78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1964 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  100 
 
 		 279 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1736  Sulphur oxidation protein SoxZ  70.56 
 
 		 276 aa  368  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2111  Sulphur oxidation protein SoxZ  69.64 
 
 		 271 aa  364  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0330798  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1775  sulphur oxidation protein SoxZ  69.64 
 
 		 271 aa  364  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  56.34 
 
 		 276 aa  317  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  42.67 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1248  hypothetical protein  42.55 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2590  hypothetical protein  42.55 
 
 		 268 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  41.18 
 
 		 269 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  41.54 
 
 		 288 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  42.55 
 
 		 278 aa  188  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2358  hypothetical protein  42.02 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  40 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3949  sulphur oxidation protein SoxZ  42.44 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1933  secreted protein-like protein  41.7 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0470  sulphur oxidation protein SoxZ  36.43 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  41.59 
 
 		 272 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3111  sulphur oxidation protein SoxZ  37.23 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  33.2 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  33.96 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  27.03 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0481  hypothetical protein  28.15 
 
 		 270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  27.38 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  25.81 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  32.58 
 
 		 163 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1825  hypothetical protein  24.27 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  24.47 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  33.33 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2105  conserved hypothetical membrane associated protein  25.26 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4960  sulfur oxidation protein SoxY  32.14 
 
 		 154 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2499  conserved hypothetical membrane associated protein  24.9 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  31.25 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1960  hypothetical protein  26.76 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0696001  normal  0.328417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1987  sulfur compound-chelating protein SoxY  33.04 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2732  hypothetical protein  25.12 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582474 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  31.08 
 
 		 162 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0724  hypothetical protein  24 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  32.35 
 
 		 157 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  33.04 
 
 		 155 aa  58.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4255  sulfur oxidation protein SoxY  29.46 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  0.239592 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3044  secreted protein-like protein  34.26 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.906276  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  32.41 
 
 		 151 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1025  hypothetical protein  25.2 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3086  hypothetical protein  23.83 
 
 		 253 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3126  hypothetical protein  23.79 
 
 		 253 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121178  normal  0.557372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2677  hypothetical protein  23.83 
 
 		 255 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2998  sulfur compound chelating protein SoxZ  28.89 
 
 		 111 aa  52.4  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1521  sulfur oxidation protein SoxY  28.57 
 
 		 157 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  33.33 
 
 		 138 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  28.7 
 
 		 150 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  32.98 
 
 		 140 aa  49.3  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  30.85 
 
 		 155 aa  48.9  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1681  thiosulfate-binding protein SoxY  30.56 
 
 		 155 aa  48.9  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2806  sulfur oxidation protein SoxY  31.18 
 
 		 138 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.283582 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2221  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  30.16 
 
 		 155 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.558685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0037  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  30.16 
 
 		 155 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  34 
 
 		 152 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  32.35 
 
 		 155 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  27.82 
 
 		 162 aa  47.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2058  sulfur oxidation protein  29.06 
 
 		 150 aa  47.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000379196  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1667  hypothetical protein  31.25 
 
 		 162 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.90923  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2284  hypothetical protein  31.25 
 
 		 162 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0560175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0695  hypothetical protein  30.49 
 
 		 103 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4157  sulfur oxidation protein SoxY  29.41 
 
 		 156 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1923  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 153 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.921102  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3675  sulfur oxidation protein  29.09 
 
 		 165 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.570689  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3715  hypothetical protein  28.57 
 
 		 110 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.104984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1907  hypothetical protein  28.57 
 
 		 110 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0857144  normal  0.079007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1576  sulfur oxidation protein SoxY  30.14 
 
 		 156 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  32.05 
 
 		 153 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2072  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  31.75 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  32 
 
 		 156 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0696  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  30.33 
 
 		 164 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4155  hypothetical protein  24.79 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1591  hypothetical protein  29.86 
 
 		 162 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1468  Sulphur oxidation protein SoxZ  25.93 
 
 		 109 aa  43.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00170779  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0565  sulfur compound chelating protein SoxZ  25.56 
 
 		 104 aa  42.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  27.96 
 
 		 168 aa  42  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.615495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>