70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4157 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4157  sulfur oxidation protein SoxY  100 
 
 		 156 aa  312  9e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  58.55 
 
 		 150 aa  171  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1521  sulfur oxidation protein SoxY  50 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4960  sulfur oxidation protein SoxY  53.45 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  53.98 
 
 		 154 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4255  sulfur oxidation protein SoxY  52.54 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  0.239592 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  48.99 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2763  sulfur oxidation protein SoxY  41.18 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0261  thiosulfate-binding protein SoxY  42.57 
 
 		 155 aa  103  7e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00586003  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1156  hypothetical protein  40.82 
 
 		 161 aa  100  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  40.88 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2806  sulfur oxidation protein SoxY  49.15 
 
 		 138 aa  98.6  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.283582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6957  sulfur oxidation protein SoxY  38.67 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  48.32 
 
 		 138 aa  97.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7669  sulfur oxidation protein SoxY  38.93 
 
 		 153 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1576  sulfur oxidation protein SoxY  40.94 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0065  sulfur oxidation protein SoxY  40.65 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  41.59 
 
 		 280 aa  87.4  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  32.28 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  35.98 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2058  sulfur oxidation protein  32.05 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000379196  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  36.84 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  36.88 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0696  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  36.63 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  38.6 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  34.06 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  38.38 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  39.78 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  37.1 
 
 		 264 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2072  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  34.97 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1667  hypothetical protein  35.09 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.90923  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2284  hypothetical protein  35.09 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0560175  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3675  sulfur oxidation protein  33.96 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.570689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1591  hypothetical protein  35.09 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  36.19 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1923  twin-arginine translocation pathway signal  37.76 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.921102  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1941  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  32.08 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310048  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0123  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  34.15 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2221  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  33.33 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.558685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0037  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  33.33 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  37.74 
 
 		 258 aa  67.4  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0812  twin-arginine translocation pathway signal  34.69 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000529367  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  31.52 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  36.36 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.615495 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  33.91 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3044  secreted protein-like protein  34.69 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.906276  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  36.73 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  36.73 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0566  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  34.69 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000123827  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3091  hypothetical protein  30.28 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  34.78 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2629  twin-arginine translocation pathway signal  34.78 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593919  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3259  hypothetical protein  34.69 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  34.58 
 
 		 283 aa  61.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  33.33 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  31.3 
 
 		 270 aa  60.5  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  34.41 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3255  twin-arginine translocation pathway signal  32.65 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1987  sulfur compound-chelating protein SoxY  31.33 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  29.06 
 
 		 287 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  32.41 
 
 		 269 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  32.46 
 
 		 266 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  29.63 
 
 		 276 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1681  thiosulfate-binding protein SoxY  31.9 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2856  hypothetical protein  30.25 
 
 		 280 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.967749  normal  0.0104603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1258  sulfur covalently-binding protein  32.32 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  26.49 
 
 		 278 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  29.41 
 
 		 279 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  28.7 
 
 		 266 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>