63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6957 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6957  sulfur oxidation protein SoxY  100 
 
 		 153 aa  301  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7669  sulfur oxidation protein SoxY  88.24 
 
 		 153 aa  270  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2763  sulfur oxidation protein SoxY  55.17 
 
 		 162 aa  154  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0065  sulfur oxidation protein SoxY  55.15 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1156  hypothetical protein  54.87 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  46.85 
 
 		 154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4255  sulfur oxidation protein SoxY  45.95 
 
 		 154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  0.239592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4960  sulfur oxidation protein SoxY  44.14 
 
 		 154 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  39.33 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1521  sulfur oxidation protein SoxY  41.78 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4157  sulfur oxidation protein SoxY  38.67 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  44.37 
 
 		 280 aa  97.4  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0261  thiosulfate-binding protein SoxY  40.82 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00586003  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1576  sulfur oxidation protein SoxY  40.14 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  34.18 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2806  sulfur oxidation protein SoxY  40.71 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.283582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  32.19 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  40.21 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  31.96 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  32.48 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  36.11 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  31.48 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  34.69 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  25 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  32.35 
 
 		 270 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  35.35 
 
 		 283 aa  58.2  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2058  sulfur oxidation protein  29.46 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000379196  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2856  hypothetical protein  34.74 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.967749  normal  0.0104603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  29.11 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  33.73 
 
 		 272 aa  54.3  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  37.37 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.615495 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  30.28 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  34.02 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  34.44 
 
 		 269 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  32.61 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0696  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  29.38 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  33.67 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  30.53 
 
 		 278 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  30.07 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  30.07 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  30.93 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  33.33 
 
 		 266 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  29.79 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3255  twin-arginine translocation pathway signal  29.79 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  31.33 
 
 		 287 aa  47  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3091  hypothetical protein  26.42 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3675  sulfur oxidation protein  28.32 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.570689  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3044  secreted protein-like protein  28.32 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.906276  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3259  hypothetical protein  28.21 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  30 
 
 		 288 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1941  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  24.84 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310048  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  27.72 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0123  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  30.49 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1923  twin-arginine translocation pathway signal  30.93 
 
 		 153 aa  43.9  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.921102  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1667  hypothetical protein  29.9 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.90923  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2284  hypothetical protein  29.9 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0560175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0037  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  28.78 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2221  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  28.78 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.558685  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0812  twin-arginine translocation pathway signal  27.84 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000529367  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2072  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  28.28 
 
 		 156 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  26.8 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0201  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  27.07 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1591  hypothetical protein  31.52 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>