83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1470 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  327  5.0000000000000004e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  43.48 
 
 
155 aa  114  6e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  38.04 
 
 
151 aa  105  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  36.65 
 
 
153 aa  103  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  35.15 
 
 
156 aa  94.7  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  37.7 
 
 
163 aa  94  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1521  sulfur oxidation protein SoxY  34.78 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4960  sulfur oxidation protein SoxY  40 
 
 
154 aa  87.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  35.37 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  44.44 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4255  sulfur oxidation protein SoxY  39.17 
 
 
154 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  0.239592 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0261  thiosulfate-binding protein SoxY  32.32 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00586003  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4157  sulfur oxidation protein SoxY  35.98 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2763  sulfur oxidation protein SoxY  32.52 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  32.54 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  38.33 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1156  hypothetical protein  31.9 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6957  sulfur oxidation protein SoxY  34.69 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2806  sulfur oxidation protein SoxY  37.89 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.283582 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3091  hypothetical protein  29.01 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  35.79 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  29.1 
 
 
272 aa  64.7  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0696  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  33.54 
 
 
164 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  31.48 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7669  sulfur oxidation protein SoxY  29.75 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1941  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  32.58 
 
 
161 aa  61.2  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310048  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  34.74 
 
 
140 aa  60.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  37.72 
 
 
162 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  33.61 
 
 
283 aa  60.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2072  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  33.54 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0123  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  34.45 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  33.61 
 
 
264 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  34.02 
 
 
270 aa  57.8  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0065  sulfur oxidation protein SoxY  30.1 
 
 
158 aa  57.8  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  28.47 
 
 
288 aa  57.8  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  30.07 
 
 
287 aa  57.8  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1576  sulfur oxidation protein SoxY  30 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3675  sulfur oxidation protein  36.21 
 
 
165 aa  57.8  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.570689  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  26.11 
 
 
276 aa  57.4  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  31.96 
 
 
280 aa  57.4  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  35.79 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.615495 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  30.08 
 
 
266 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  37.61 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0566  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  33.68 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000123827  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  32.76 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  27.44 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3255  twin-arginine translocation pathway signal  32.76 
 
 
151 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  27.44 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  37.5 
 
 
155 aa  54.3  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3259  hypothetical protein  31.71 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  30.53 
 
 
271 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2058  sulfur oxidation protein  30.43 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000379196  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  35.9 
 
 
150 aa  53.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1923  twin-arginine translocation pathway signal  29.41 
 
 
153 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.921102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  35.79 
 
 
266 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1667  hypothetical protein  36.36 
 
 
162 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.90923  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2284  hypothetical protein  36.36 
 
 
162 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0560175  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1591  hypothetical protein  30.67 
 
 
162 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  30.16 
 
 
155 aa  50.8  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1736  Sulphur oxidation protein SoxZ  28.79 
 
 
276 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2111  Sulphur oxidation protein SoxZ  27.48 
 
 
271 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0330798  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1987  sulfur compound-chelating protein SoxY  31.75 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3949  sulphur oxidation protein SoxZ  33.33 
 
 
270 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3044  secreted protein-like protein  33.33 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.906276  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1775  sulphur oxidation protein SoxZ  27.48 
 
 
271 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1025  hypothetical protein  30.93 
 
 
256 aa  48.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2221  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  27.88 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.558685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0037  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  27.88 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  32.99 
 
 
269 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0812  twin-arginine translocation pathway signal  29.41 
 
 
153 aa  48.1  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000529367  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1825  hypothetical protein  28.87 
 
 
281 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3111  sulphur oxidation protein SoxZ  30 
 
 
277 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4155  hypothetical protein  26.32 
 
 
260 aa  45.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  29.17 
 
 
258 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  27.56 
 
 
279 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2358  hypothetical protein  33.98 
 
 
256 aa  45.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2629  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593919  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1248  hypothetical protein  29.66 
 
 
268 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2590  hypothetical protein  31.03 
 
 
268 aa  41.2  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0470  sulphur oxidation protein SoxZ  30.61 
 
 
290 aa  41.2  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1960  hypothetical protein  28.28 
 
 
249 aa  40.8  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0696001  normal  0.328417 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1933  secreted protein-like protein  30.7 
 
 
268 aa  40.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2677  hypothetical protein  28 
 
 
255 aa  40.4  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218431  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>