77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2188 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  580  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  64.71 
 
 		 287 aa  345  4e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  44.92 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  40.64 
 
 		 270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3111  sulphur oxidation protein SoxZ  40.25 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0470  sulphur oxidation protein SoxZ  34.57 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  34.97 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  36.56 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  34.88 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  30.04 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2111  Sulphur oxidation protein SoxZ  28.45 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0330798  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1775  sulphur oxidation protein SoxZ  28.45 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1736  Sulphur oxidation protein SoxZ  28.57 
 
 		 276 aa  125  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  29.89 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  29.48 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1933  secreted protein-like protein  30.8 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2358  hypothetical protein  32.57 
 
 		 256 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1248  hypothetical protein  30.38 
 
 		 268 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2590  hypothetical protein  30.51 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  27.03 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3949  sulphur oxidation protein SoxZ  30 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0481  hypothetical protein  29.44 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  27.95 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  33.6 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4255  sulfur oxidation protein SoxY  34.21 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  0.239592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4960  sulfur oxidation protein SoxY  34.21 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  31.5 
 
 		 150 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  31.06 
 
 		 163 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  35.09 
 
 		 154 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  28.31 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  36.67 
 
 		 151 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  35.9 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  31.29 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2499  conserved hypothetical membrane associated protein  25.97 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2105  conserved hypothetical membrane associated protein  25.97 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  26.84 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4157  sulfur oxidation protein SoxY  34.58 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1025  hypothetical protein  26.94 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2732  hypothetical protein  25.93 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582474 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  33.61 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0724  hypothetical protein  25.87 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  37.62 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1521  sulfur oxidation protein SoxY  32.14 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1576  sulfur oxidation protein SoxY  39.39 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  35.58 
 
 		 152 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6957  sulfur oxidation protein SoxY  35.35 
 
 		 153 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1825  hypothetical protein  26.61 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2058  sulfur oxidation protein  28.86 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000379196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2763  sulfur oxidation protein SoxY  33 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7669  sulfur oxidation protein SoxY  34.02 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0261  thiosulfate-binding protein SoxY  36 
 
 		 155 aa  54.7  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00586003  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  33.98 
 
 		 155 aa  53.5  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  30.36 
 
 		 156 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3715  hypothetical protein  26.67 
 
 		 110 aa  52.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.104984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1907  hypothetical protein  26.67 
 
 		 110 aa  52.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0857144  normal  0.079007 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1960  hypothetical protein  28.07 
 
 		 249 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0696001  normal  0.328417 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0030  sulfur oxidation protein SoxZ  30.77 
 
 		 98 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.938219  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1156  hypothetical protein  32.61 
 
 		 161 aa  50.4  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  33.33 
 
 		 102 aa  49.3  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324159  hitchhiker  0.00558497 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3091  hypothetical protein  25.16 
 
 		 157 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  28.89 
 
 		 98 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0566  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  34.31 
 
 		 155 aa  47  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000123827  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0565  sulfur compound chelating protein SoxZ  30.12 
 
 		 104 aa  45.8  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  33.66 
 
 		 151 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  31.37 
 
 		 168 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.615495 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2806  sulfur oxidation protein SoxY  31.43 
 
 		 138 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.283582 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1989  sulfur compound-chelating protein SoxZ  26.56 
 
 		 100 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  35.92 
 
 		 150 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1941  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  31.36 
 
 		 161 aa  43.5  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310048  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3045  hypothetical protein  28.17 
 
 		 104 aa  43.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1259  Sulphur oxidation protein SoxZ  33.33 
 
 		 107 aa  42.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3086  hypothetical protein  24.9 
 
 		 253 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0144  sulphur oxidation protein SoxZ  25.3 
 
 		 103 aa  42.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  33.93 
 
 		 162 aa  42.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2856  hypothetical protein  21.56 
 
 		 280 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.967749  normal  0.0104603 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  35.92 
 
 		 150 aa  42.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0064  sulphur oxidation protein SoxZ  25.53 
 
 		 106 aa  42.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.956687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>