22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0481 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0481  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  544  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  33.89 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  32.49 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2590  hypothetical protein  32.68 
 
 		 268 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3949  sulphur oxidation protein SoxZ  31.28 
 
 		 270 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1248  hypothetical protein  32.28 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1933  secreted protein-like protein  33.47 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  28.15 
 
 		 279 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  27.91 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0470  sulphur oxidation protein SoxZ  32.93 
 
 		 290 aa  112  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  30.96 
 
 		 288 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  30.13 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1736  Sulphur oxidation protein SoxZ  29.92 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  28.03 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1775  sulphur oxidation protein SoxZ  29.51 
 
 		 271 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2111  Sulphur oxidation protein SoxZ  29.51 
 
 		 271 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0330798  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  30.91 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3111  sulphur oxidation protein SoxZ  30.65 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2358  hypothetical protein  31.09 
 
 		 256 aa  98.6  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  28.74 
 
 		 264 aa  92  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  28.22 
 
 		 283 aa  90.1  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  28.7 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>