More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3999 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3999  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 96 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3930  dihydrodipicolinate synthetase  95.24 
 
 		 299 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4039  dihydrodipicolinate synthetase  91.67 
 
 		 299 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5022  dihydrodipicolinate synthetase  91.67 
 
 		 299 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4989  dihydrodipicolinate synthetase  90.48 
 
 		 299 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3972  dihydrodipicolinate synthetase  89.29 
 
 		 299 aa  148  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3845  dihydrodipicolinate synthetase  77.38 
 
 		 299 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3957  dihydrodipicolinate synthetase  77.38 
 
 		 299 aa  133  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  44.87 
 
 		 326 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  45.21 
 
 		 302 aa  65.1  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 294 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  47.22 
 
 		 301 aa  64.3  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6698  putative dihydrodipicolinate synthase  44 
 
 		 303 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  42.47 
 
 		 294 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  42.47 
 
 		 296 aa  61.6  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0257  dihydrodipicolinate synthase  37.97 
 
 		 296 aa  61.2  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.457936  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  40.79 
 
 		 291 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  40.54 
 
 		 296 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  42.47 
 
 		 294 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  38.64 
 
 		 297 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  42.67 
 
 		 299 aa  60.1  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  43.84 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00126  dihydrodipicolinate synthase  43.66 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  40.54 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  43.06 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  40.54 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  41.1 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  41.1 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  36.36 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  42.25 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  39.73 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  38.36 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  42.25 
 
 		 292 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  35.23 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  35.23 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  35.14 
 
 		 304 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  40.51 
 
 		 304 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  36 
 
 		 304 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  40 
 
 		 291 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  39.73 
 
 		 294 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  36 
 
 		 304 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  40.54 
 
 		 292 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  37.33 
 
 		 304 aa  57.4  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  35.23 
 
 		 298 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  35.56 
 
 		 298 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6487  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  42.31 
 
 		 313 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1046  dihydrodipicolinate synthetase  40.51 
 
 		 304 aa  57.4  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6171  dihydrodipicolinate synthetase  40.54 
 
 		 294 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  38.67 
 
 		 291 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  36.62 
 
 		 294 aa  57  0.00000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2446  putative dihydrodipicolinate synthetase  38.36 
 
 		 303 aa  57  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  36.62 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1084  dihydrodipicolinate synthetase  45.71 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00262766  hitchhiker  0.00208818 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  38.36 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  41.67 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1435  dihydrodipicolinate synthetase  36.11 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  35.62 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  36.62 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  35.21 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  40.85 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6692  dihydrodipicolinate synthetase  40.85 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  37.66 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  35.21 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48000  putative dihydrodipicolinate synthetase  34.15 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00397266  normal  0.801152 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  35.21 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4138  putative dihydrodipicolinate synthetase  34.15 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  38.46 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  39.73 
 
 		 297 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1160  dihydrodipicolinate synthetase  40 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  38.36 
 
 		 292 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  39.73 
 
 		 292 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1441  dihydrodipicolinate synthetase  36.49 
 
 		 294 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.681531  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  36.62 
 
 		 293 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  36.62 
 
 		 301 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  39.19 
 
 		 308 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09012  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02270)  41.77 
 
 		 298 aa  54.7  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3836  dihydrodipicolinate synthase, putative  36.49 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  40.85 
 
 		 319 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  36.99 
 
 		 290 aa  54.7  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  34.18 
 
 		 304 aa  54.3  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  46.55 
 
 		 292 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  41.54 
 
 		 310 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0415  N-acetylneuraminate lyase  35.62 
 
 		 295 aa  54.3  0.0000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.275578  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  45.07 
 
 		 298 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  35.44 
 
 		 296 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  36.62 
 
 		 308 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  38.46 
 
 		 292 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  36.62 
 
 		 293 aa  53.9  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  35.21 
 
 		 301 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  35.21 
 
 		 307 aa  53.9  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  36.62 
 
 		 293 aa  53.9  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5532  dihydrodipicolinate synthetase  41.67 
 
 		 301 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  36.49 
 
 		 295 aa  53.5  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2739  dihydrodipicolinate synthetase  37.33 
 
 		 312 aa  53.9  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145378  normal  0.165925 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  38.03 
 
 		 301 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  36 
 
 		 292 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3799  dihydrodipicolinate synthetase  38.03 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  35.21 
 
 		 320 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  37.66 
 
 		 296 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0150  dihydrodipicolinate synthase  38.55 
 
 		 299 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.613999  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>