More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0415 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0415  N-acetylneuraminate lyase  100 
 
 		 295 aa  586  1e-166  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.275578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  50.52 
 
 		 288 aa  296  3e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0695  N-acetylneuraminate lyase  50.51 
 
 		 292 aa  296  3e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0175  N-acetylneuraminate lyase  50.52 
 
 		 288 aa  295  5e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0305  N-acetylneuraminate lyase  48.34 
 
 		 293 aa  267  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0298  N-acetylneuraminate lyase  48.34 
 
 		 293 aa  267  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2156  dihydrodipicolinate synthetase  43.92 
 
 		 298 aa  248  6e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  37.29 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  36.95 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  36.95 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  36.95 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  36.95 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  36.95 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  36.95 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  38.19 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  36.95 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  36.95 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  37.41 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3661  N-acetylneuraminate lyase  36.39 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.529009  normal  0.169481 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  37.41 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  37.41 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  38.19 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3832  N-acetylneuraminate lyase  36.03 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1047  N-acetylneuraminate lyase  32.51 
 
 		 309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  33.05 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  30.11 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  31.25 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  31.73 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  30.42 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  33.19 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  29.88 
 
 		 371 aa  126  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  32.64 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3485  dihydrodipicolinate synthetase  31.37 
 
 		 289 aa  125  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  31.3 
 
 		 297 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  31.12 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  29.5 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.83 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  31 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 300 aa  122  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  32.08 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  28.11 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2614  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2643  dihydrodipicolinate synthase  26.42 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2658  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  31.22 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  31.22 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  31.22 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  31.91 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  31.76 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  31.47 
 
 		 290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  31.22 
 
 		 293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  27.33 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  32.07 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  31.47 
 
 		 290 aa  119  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  31.78 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  26.67 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.93 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  26.97 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  32.19 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  30.17 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6633  dihydrodipicolinate synthase  30.18 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  24.32 
 
 		 319 aa  115  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  27.46 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  30.08 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09438  dihydrodipicolinate synthase  26.85 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  30.17 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  26.78 
 
 		 294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  29.66 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0039  N-acetylneuraminate lyase, putative  29.89 
 
 		 305 aa  113  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3319  dihydrodipicolinate synthase  30.55 
 
 		 293 aa  113  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.343226 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.21 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  28.32 
 
 		 296 aa  113  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  31.95 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3573  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 		 308 aa  112  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.283076  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1167  putative dihydrodipicolinate synthetase  27.73 
 
 		 314 aa  112  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  32.38 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  31.94 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  27.34 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0828  dihydrodipicolinate synthase  38.24 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  31.65 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  27.98 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  29.68 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  32.23 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1335  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.21 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.106036 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  26.77 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  31.82 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  30.16 
 
 		 291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  30.16 
 
 		 291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>