More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3485 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3485  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 289 aa  591  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3832  N-acetylneuraminate lyase  30.69 
 
 		 302 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  35.02 
 
 		 288 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0175  N-acetylneuraminate lyase  35.02 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0298  N-acetylneuraminate lyase  31.25 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0305  N-acetylneuraminate lyase  31.25 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  32.28 
 
 		 297 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  32.28 
 
 		 297 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  32.28 
 
 		 297 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  32.28 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  31.93 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  32.33 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3661  N-acetylneuraminate lyase  31 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.529009  normal  0.169481 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  32.33 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  32.33 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  32.33 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  32.33 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  32.33 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  32.33 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  32.33 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  32.33 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0695  N-acetylneuraminate lyase  32.04 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2156  dihydrodipicolinate synthetase  31.43 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0415  N-acetylneuraminate lyase  31.37 
 
 		 295 aa  125  7e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.275578  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1047  N-acetylneuraminate lyase  29.89 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  30.25 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  26.53 
 
 		 291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0090  Dihydrodipicolinate synthase  27.92 
 
 		 289 aa  108  9.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.54 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2213  N-acetylneuraminate lyase  27.86 
 
 		 308 aa  102  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1335  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.44 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.106036 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  23.79 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3845  dihydrodipicolinate synthetase  25.89 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0999  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  26.26 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1946  dihydrodipicolinate synthetase  28.89 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191392  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3972  dihydrodipicolinate synthetase  25.28 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2063  dihydrodipicolinate synthase  29.37 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  24.16 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3957  dihydrodipicolinate synthetase  25.81 
 
 		 299 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 297 aa  99.4  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4039  dihydrodipicolinate synthetase  25.28 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5022  dihydrodipicolinate synthetase  25.28 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3930  dihydrodipicolinate synthetase  24.91 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  28.12 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  24.04 
 
 		 292 aa  95.9  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1388  dihydrodipicolinate synthetase  24.83 
 
 		 287 aa  95.9  7e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.459727  normal  0.509229 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  24.31 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  25.26 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1620  dihydrodipicolinate synthetase  26.13 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4110  dihydrodipicolinate synthetase  25.34 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  25.55 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  22.7 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  24.4 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  27.86 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  23.94 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  25.71 
 
 		 296 aa  92.8  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4989  dihydrodipicolinate synthetase  24.91 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  23.51 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  27.18 
 
 		 292 aa  92.4  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  26.06 
 
 		 297 aa  92.4  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0615  dihydrodipicolinate synthase  25.35 
 
 		 307 aa  92.4  9e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1374  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.32 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.3 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0934  dihydrodipicolinate synthetase  27.78 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.090977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  28.32 
 
 		 301 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3063  dihydrodipicolinate synthase, putative  27.46 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586841  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  23.96 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  23.4 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3237  dihydrodipicolinate synthase  23.93 
 
 		 286 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115638  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  26.26 
 
 		 293 aa  89.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  23 
 
 		 295 aa  89.7  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  25.9 
 
 		 301 aa  89.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1729  dihydrodipicolinate synthase  28.07 
 
 		 297 aa  89.4  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0274763  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21211  dihydrodipicolinate synthase  25.86 
 
 		 315 aa  89.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  23.93 
 
 		 292 aa  89  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  23.93 
 
 		 292 aa  89  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  23.93 
 
 		 292 aa  89  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  23.93 
 
 		 292 aa  89  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  23.93 
 
 		 292 aa  89  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5758  dihydrodipicolinate synthetase  24.3 
 
 		 295 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  23.93 
 
 		 292 aa  89  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5807  dihydrodipicolinate synthase  24.65 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  25.69 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  26.45 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0039  N-acetylneuraminate lyase, putative  26.18 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1251  dihydrodipicolinate synthase  25.52 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  23.21 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  27.86 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  25.71 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  23.21 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  23.61 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1273  dihydrodipicolinate synthase  24.66 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4685  dihydrodipicolinate synthetase  32.35 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  25.45 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  24.73 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  26.41 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.78 
 
 		 313 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4841  dihydrodipicolinate synthase  25.63 
 
 		 292 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00571792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  23.81 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>