More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2156 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2156  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 298 aa  611  9.999999999999999e-175  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0695  N-acetylneuraminate lyase  43.39 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  45.56 
 
 		 288 aa  269  4e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0175  N-acetylneuraminate lyase  45.56 
 
 		 288 aa  269  5e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0305  N-acetylneuraminate lyase  40.68 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0298  N-acetylneuraminate lyase  40.68 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0415  N-acetylneuraminate lyase  43.92 
 
 		 295 aa  248  6e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.275578  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  40.37 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  40.52 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  40.52 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  40.52 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  40.52 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  40.22 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  39.85 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  39.85 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  39.85 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  39.85 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  39.85 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  39.85 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  39.85 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  39.85 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3661  N-acetylneuraminate lyase  38.78 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.529009  normal  0.169481 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3832  N-acetylneuraminate lyase  33.46 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3485  dihydrodipicolinate synthetase  31.43 
 
 		 289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1047  N-acetylneuraminate lyase  29.76 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0039  N-acetylneuraminate lyase, putative  27.12 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2213  N-acetylneuraminate lyase  28.57 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 		 297 aa  115  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  29.15 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  31.76 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0646  dihydrodipicolinate synthetase  25.1 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7523  dihydrodipicolinate synthase  28.74 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  30.71 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1452  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  32.1 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  28.18 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  27.51 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  27.74 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  31.93 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  31.93 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  23.83 
 
 		 294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  27.46 
 
 		 293 aa  108  7.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  29.96 
 
 		 293 aa  108  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  31.93 
 
 		 296 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2614  dihydrodipicolinate synthase  26.58 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0899  dihydropicolinate synthase  28.68 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.442458  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2658  dihydrodipicolinate synthase  26.58 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28394  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  29.96 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2643  dihydrodipicolinate synthase  26.58 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  29.66 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  29.96 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  28.51 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  26.8 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  29.8 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3023  dihydrodipicolinate synthetase  28.85 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3709  dihydrodipicolinate synthetase  22.92 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.646628  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3538  dihydrodipicolinate synthetase  22.92 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.423247  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3573  dihydrodipicolinate synthetase  29.74 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.283076  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  26.4 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  28.27 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  29.84 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  26.53 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  27.23 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  25.84 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  33.05 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  26.53 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  23.73 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  30.04 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  25.68 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  30.08 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  25.5 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  25.4 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1374  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.57 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 		 294 aa  99.4  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  32.48 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  30.08 
 
 		 290 aa  99.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  24.66 
 
 		 332 aa  99  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3944  dihydrodipicolinate synthase  27 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  27.9 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  30.08 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  30.93 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  27.43 
 
 		 290 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  31.76 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  30.93 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  26.16 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1335  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.27 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.106036 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  25.68 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  23.37 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  29.54 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  27.35 
 
 		 341 aa  97.1  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3237  dihydrodipicolinate synthase  26.81 
 
 		 286 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115638  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  26.21 
 
 		 313 aa  96.3  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 		 292 aa  96.3  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  31.31 
 
 		 291 aa  96.3  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2280  dihydrodipicolinate synthetase  26.04 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0107583  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0934  dihydrodipicolinate synthetase  27.27 
 
 		 294 aa  95.9  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.090977  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1522  dihydrodipicolinate synthetase  26.97 
 
 		 301 aa  95.9  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>