More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1374 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1374  dihydrodipicolinate synthetase family protein  100 
 
 		 298 aa  610  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1400  dihydrodipicolinate synthetase  75.09 
 
 		 297 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.13834  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1293  putative N-acetylneuraminate lyase  75.09 
 
 		 297 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.519377  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0899  dihydropicolinate synthase  73.31 
 
 		 297 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.442458  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2776  putative N-acetylneuraminate lyase  75.09 
 
 		 297 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1522  dihydrodipicolinate synthetase  71.28 
 
 		 301 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2213  N-acetylneuraminate lyase  40.8 
 
 		 308 aa  241  9e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2625  dihydrodipicolinate synthetase  40.62 
 
 		 315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3256  dihydrodipicolinate synthetase  37.89 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0185396  normal  0.0566926 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3023  dihydrodipicolinate synthetase  39.73 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1946  dihydrodipicolinate synthetase  37.84 
 
 		 305 aa  202  7e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191392  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2063  N-acetylneuraminate lyase  36.12 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000571385  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3832  N-acetylneuraminate lyase  28.42 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0298  N-acetylneuraminate lyase  29.55 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0305  N-acetylneuraminate lyase  29.55 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1047  N-acetylneuraminate lyase  29.57 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  29.2 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  29.2 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  29.2 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  29.2 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  29.2 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  29.2 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  29.2 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  29.2 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  29.2 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  26.48 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3661  N-acetylneuraminate lyase  28.17 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.529009  normal  0.169481 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  28.57 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  28.57 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  28.57 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  28.57 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  28.57 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3573  dihydrodipicolinate synthetase  27.7 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.283076  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  26.91 
 
 		 305 aa  102  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0415  N-acetylneuraminate lyase  29.96 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.275578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  27.21 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  28.57 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  29.37 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2156  dihydrodipicolinate synthetase  28.57 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.56 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.03 
 
 		 313 aa  99.4  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 		 298 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  26.87 
 
 		 298 aa  99.4  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  26.28 
 
 		 291 aa  99.4  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0774  dihydrodipicolinate synthase  26.74 
 
 		 292 aa  99  8e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.392848  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  27.02 
 
 		 297 aa  99  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  25.7 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  27.59 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  26.87 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.99 
 
 		 313 aa  97.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  26.87 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  25.51 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  26.86 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  26.91 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  26.64 
 
 		 298 aa  95.5  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  26.64 
 
 		 298 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  25.26 
 
 		 289 aa  95.5  9e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  26.64 
 
 		 298 aa  95.5  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  26.62 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1978  dihydrodipicolinate synthetase  29.27 
 
 		 296 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.578395  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  25.25 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  26.41 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0175  N-acetylneuraminate lyase  26.71 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 		 290 aa  93.6  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  26.52 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  24.75 
 
 		 289 aa  93.6  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  24.91 
 
 		 289 aa  93.6  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0039  N-acetylneuraminate lyase, putative  26.3 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  24.73 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  27.61 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  27.42 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  27.42 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  26.99 
 
 		 294 aa  92.4  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  27.49 
 
 		 295 aa  92.4  8e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  27.76 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  26.35 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  26.35 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3485  dihydrodipicolinate synthetase  28.32 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0695  N-acetylneuraminate lyase  25.17 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  26.53 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1917  dihydrodipicolinate synthetase  26.42 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  27.18 
 
 		 291 aa  90.9  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  26.8 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  27.68 
 
 		 294 aa  89.7  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  26.47 
 
 		 301 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  24.49 
 
 		 292 aa  89.4  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  27.17 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  26.46 
 
 		 290 aa  89.4  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  26.21 
 
 		 296 aa  89  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>