More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2063 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2063  N-acetylneuraminate lyase  100 
 
 		 307 aa  628  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000571385  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3256  dihydrodipicolinate synthetase  42.76 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0185396  normal  0.0566926 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3023  dihydrodipicolinate synthetase  39.73 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2213  N-acetylneuraminate lyase  40.4 
 
 		 308 aa  219  7e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2625  dihydrodipicolinate synthetase  38.94 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1522  dihydrodipicolinate synthetase  37.46 
 
 		 301 aa  202  7e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1374  dihydrodipicolinate synthetase family protein  36.12 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1293  putative N-acetylneuraminate lyase  35.93 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.519377  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1400  dihydrodipicolinate synthetase  35.93 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.13834  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2776  putative N-acetylneuraminate lyase  35.93 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216717 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0899  dihydropicolinate synthase  35.57 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.442458  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1946  dihydrodipicolinate synthetase  35.45 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191392  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1047  N-acetylneuraminate lyase  29.43 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3832  N-acetylneuraminate lyase  28.04 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217271  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0039  N-acetylneuraminate lyase, putative  27.87 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  28.29 
 
 		 298 aa  99.4  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  26.55 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  27.1 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  27.1 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  27.1 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  27.1 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  27.1 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  27.48 
 
 		 297 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  27.48 
 
 		 297 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  27.48 
 
 		 297 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  27.48 
 
 		 297 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  27.48 
 
 		 297 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  27.48 
 
 		 297 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  27.48 
 
 		 297 aa  95.5  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  27.48 
 
 		 297 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  27.48 
 
 		 297 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3709  dihydrodipicolinate synthetase  25.68 
 
 		 294 aa  92.8  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.646628  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0813  dihydrodipicolinate synthetase  25.85 
 
 		 302 aa  92.4  7e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  28.46 
 
 		 302 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3538  dihydrodipicolinate synthetase  25.68 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.423247  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  25.34 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0298  N-acetylneuraminate lyase  25.99 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  25.61 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  25.61 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0305  N-acetylneuraminate lyase  25.99 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  27.01 
 
 		 298 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3573  dihydrodipicolinate synthetase  26.79 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.283076  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  26.46 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0090  Dihydrodipicolinate synthase  25.82 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  26.6 
 
 		 290 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0646  dihydrodipicolinate synthetase  25.17 
 
 		 294 aa  89.7  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 		 298 aa  89.7  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  26.07 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1620  dihydrodipicolinate synthetase  24.16 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3661  N-acetylneuraminate lyase  25.76 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.529009  normal  0.169481 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  25.08 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  27.98 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  26.67 
 
 		 288 aa  85.9  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0175  N-acetylneuraminate lyase  26.67 
 
 		 288 aa  85.5  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  24.58 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  24.38 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  25.87 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  27.27 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2156  dihydrodipicolinate synthetase  26.69 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  27.11 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2063  dihydrodipicolinate synthase  25.8 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4841  dihydrodipicolinate synthase  24.66 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00571792 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  23.99 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  23.69 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  23.99 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  24.11 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2280  dihydrodipicolinate synthetase  28.24 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0107583  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  26.87 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  24.49 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  24.69 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  25.51 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  23.79 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  24.32 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  23.55 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  25.85 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  24.32 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  26.89 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  23.65 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  24.32 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  26.24 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1388  dihydrodipicolinate synthetase  27.24 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.459727  normal  0.509229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  26.89 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  23.34 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  23.34 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  22.84 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  23.73 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  23.34 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  23.34 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  23.34 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  23.34 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  23.31 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  23.34 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  24.22 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  23.34 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  25.52 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0934  dihydrodipicolinate synthetase  25.17 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.090977  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0415  N-acetylneuraminate lyase  26.8 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.275578  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  24.92 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  24.39 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>