More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3256 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3256  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 314 aa  651    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0185396  normal  0.0566926 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3023  dihydrodipicolinate synthetase  69.1 
 
 		 313 aa  429  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2625  dihydrodipicolinate synthetase  53.47 
 
 		 315 aa  323  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2063  N-acetylneuraminate lyase  42.76 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000571385  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2213  N-acetylneuraminate lyase  38.82 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1522  dihydrodipicolinate synthetase  41.06 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1946  dihydrodipicolinate synthetase  39.13 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191392  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1293  putative N-acetylneuraminate lyase  38.95 
 
 		 297 aa  215  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.519377  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2776  putative N-acetylneuraminate lyase  38.95 
 
 		 297 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1400  dihydrodipicolinate synthetase  38.95 
 
 		 297 aa  215  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.13834  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1374  dihydrodipicolinate synthetase family protein  37.89 
 
 		 298 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0899  dihydropicolinate synthase  36.14 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.442458  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1620  dihydrodipicolinate synthetase  27.72 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  27.44 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  27.44 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  27.44 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  27.44 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  27.08 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3832  N-acetylneuraminate lyase  24.91 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  27.44 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  27.44 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  27.44 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  27.44 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  27.08 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  27.08 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  26.71 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  25.08 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  26.71 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  26.71 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0415  N-acetylneuraminate lyase  26.64 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.275578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  25.84 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2156  dihydrodipicolinate synthetase  26.64 
 
 		 298 aa  89.4  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  23.99 
 
 		 291 aa  89.4  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  25.5 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1047  N-acetylneuraminate lyase  25.25 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  25.18 
 
 		 289 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0305  N-acetylneuraminate lyase  26.95 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0298  N-acetylneuraminate lyase  26.95 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  28.11 
 
 		 288 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0175  N-acetylneuraminate lyase  28.11 
 
 		 288 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  26.28 
 
 		 292 aa  86.3  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  25.18 
 
 		 289 aa  86.3  6e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0695  N-acetylneuraminate lyase  27.05 
 
 		 292 aa  85.9  8e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0090  Dihydrodipicolinate synthase  24.65 
 
 		 289 aa  85.9  9e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3573  dihydrodipicolinate synthetase  28.64 
 
 		 308 aa  85.9  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.283076  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0039  N-acetylneuraminate lyase, putative  25.42 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3661  N-acetylneuraminate lyase  26.24 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.529009  normal  0.169481 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  24.07 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  24.49 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  24.33 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  24.32 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  26.28 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  26.28 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  26.28 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  26.28 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  26.28 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  26.28 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2063  dihydrodipicolinate synthase  25.91 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  26.55 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  26.55 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  23.47 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3485  dihydrodipicolinate synthetase  28.83 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5758  dihydrodipicolinate synthetase  26.69 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  23.75 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  27.2 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  26.21 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2280  dihydrodipicolinate synthetase  26.09 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0107583  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  26.29 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  27.62 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  24.4 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2190  dihydrodipicolinate synthase  23.89 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  27.01 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  23.02 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  21.74 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  25 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  23.39 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2140  dihydrodipicolinate synthase  25.96 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  24.25 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5807  dihydrodipicolinate synthase  26.55 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  23.93 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  24.4 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  24.9 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  23.57 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  21.74 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  24.4 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  23.31 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  24.41 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  23.18 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  24.33 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  24.32 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  24.67 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2639  dihydrodipicolinate synthase  24.75 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  24.4 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  23.86 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  24.67 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  26.28 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  25.95 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3193  dihydrodipicolinate synthase  25.52 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  24.31 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  24.79 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>