More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2625 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2625  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 315 aa  642    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3256  dihydrodipicolinate synthetase  53.47 
 
 		 314 aa  340  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0185396  normal  0.0566926 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3023  dihydrodipicolinate synthetase  52.79 
 
 		 313 aa  321  8e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1374  dihydrodipicolinate synthetase family protein  40.62 
 
 		 298 aa  235  9e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1946  dihydrodipicolinate synthetase  42.81 
 
 		 305 aa  231  8.000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191392  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2063  N-acetylneuraminate lyase  38.94 
 
 		 307 aa  229  5e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000571385  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2213  N-acetylneuraminate lyase  37.29 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1522  dihydrodipicolinate synthetase  36.79 
 
 		 301 aa  211  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1293  putative N-acetylneuraminate lyase  36.95 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.519377  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2776  putative N-acetylneuraminate lyase  36.95 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1400  dihydrodipicolinate synthetase  36.95 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.13834  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0899  dihydropicolinate synthase  34.46 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.442458  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  31.56 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3832  N-acetylneuraminate lyase  30.32 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217271  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  31.18 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  31.18 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  31.18 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  31.18 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  31.18 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  31.18 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  31.18 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  31.18 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  30.45 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  30.45 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  30.45 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3661  N-acetylneuraminate lyase  31.18 
 
 		 297 aa  119  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.529009  normal  0.169481 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  30.65 
 
 		 297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  29.58 
 
 		 297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2190  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  27.08 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  25.9 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2156  dihydrodipicolinate synthetase  27.06 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  25.9 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  25.9 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  25.9 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  25.9 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  25.9 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  25.9 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  27.08 
 
 		 296 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  28.92 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  25.54 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  27.46 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  29.35 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  25.54 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  27.3 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 		 296 aa  99.8  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  27.02 
 
 		 341 aa  99.4  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  28.06 
 
 		 294 aa  99  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5807  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 298 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  28.41 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0039  N-acetylneuraminate lyase, putative  26.46 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2280  dihydrodipicolinate synthetase  30.41 
 
 		 306 aa  97.1  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0107583  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  25.36 
 
 		 291 aa  97.1  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  30.1 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  26.6 
 
 		 294 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0695  N-acetylneuraminate lyase  26.22 
 
 		 292 aa  95.9  7e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0305  N-acetylneuraminate lyase  27.21 
 
 		 293 aa  95.5  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  27.12 
 
 		 307 aa  95.9  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0298  N-acetylneuraminate lyase  27.21 
 
 		 293 aa  95.5  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2116  dihydrodipicolinate synthase  27.53 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2162  dihydrodipicolinate synthase  27.53 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3452  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2103  dihydrodipicolinate synthase  27.53 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  0.145144 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  25.89 
 
 		 294 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  26.64 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  28.72 
 
 		 288 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  25.61 
 
 		 291 aa  93.6  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0175  N-acetylneuraminate lyase  28.72 
 
 		 288 aa  93.6  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  27.7 
 
 		 290 aa  93.2  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5758  dihydrodipicolinate synthetase  28.47 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  26.99 
 
 		 295 aa  92.8  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  24.48 
 
 		 294 aa  92.4  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2063  dihydrodipicolinate synthase  25.99 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  23.49 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  25.85 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  27.34 
 
 		 296 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1047  N-acetylneuraminate lyase  24.84 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  27.34 
 
 		 296 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  25.54 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1273  dihydrodipicolinate synthase  26.26 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  26.41 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  27.3 
 
 		 290 aa  90.1  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  25.9 
 
 		 292 aa  90.1  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0774  dihydrodipicolinate synthase  26.57 
 
 		 292 aa  90.1  5e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.392848  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  25.99 
 
 		 292 aa  89.7  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  25.82 
 
 		 320 aa  89.7  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 294 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  26.8 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  27.34 
 
 		 298 aa  89.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  27.53 
 
 		 296 aa  89.4  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  24.64 
 
 		 308 aa  89.4  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2144  dihydrodipicolinate synthase  29.45 
 
 		 327 aa  89  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00221445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  26.16 
 
 		 294 aa  89  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  26.57 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  25.62 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  26.98 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  27.34 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  26.87 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  27.34 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  27.08 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>