More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3023 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3023  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 313 aa  649    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3256  dihydrodipicolinate synthetase  69.1 
 
 		 314 aa  442  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0185396  normal  0.0566926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2625  dihydrodipicolinate synthetase  52.79 
 
 		 315 aa  314  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2213  N-acetylneuraminate lyase  42.37 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2063  N-acetylneuraminate lyase  40.07 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000571385  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1946  dihydrodipicolinate synthetase  40.94 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191392  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1522  dihydrodipicolinate synthetase  39.6 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1374  dihydrodipicolinate synthetase family protein  40.07 
 
 		 298 aa  220  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1293  putative N-acetylneuraminate lyase  39.72 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.519377  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1400  dihydrodipicolinate synthetase  39.72 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.13834  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2776  putative N-acetylneuraminate lyase  39.72 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216717 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0899  dihydropicolinate synthase  37.94 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.442458  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3832  N-acetylneuraminate lyase  27.8 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  31.38 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2156  dihydrodipicolinate synthetase  28.85 
 
 		 298 aa  108  8.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  27.02 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  26.44 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3661  N-acetylneuraminate lyase  28.73 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.529009  normal  0.169481 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  28.67 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  29.52 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  30.42 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  29.92 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  29.92 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  29.92 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  28.57 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  28.57 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  25.76 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  28.57 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  28.57 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  28.57 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  26.86 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  28.57 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  28.57 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  28.57 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.8 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  26.13 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0175  N-acetylneuraminate lyase  26.13 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  28.57 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  28.08 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  25.76 
 
 		 289 aa  99.4  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  26.79 
 
 		 289 aa  99  9e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  28.18 
 
 		 298 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0298  N-acetylneuraminate lyase  28.11 
 
 		 293 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0305  N-acetylneuraminate lyase  28.11 
 
 		 293 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0415  N-acetylneuraminate lyase  28.36 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.275578  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0695  N-acetylneuraminate lyase  26.99 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1047  N-acetylneuraminate lyase  27.03 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  27.05 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  27.05 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  27.05 
 
 		 292 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  27.05 
 
 		 292 aa  97.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  27.05 
 
 		 292 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  27.05 
 
 		 292 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  26.69 
 
 		 292 aa  97.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  27.05 
 
 		 292 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  27.05 
 
 		 292 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  27.64 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  25.75 
 
 		 291 aa  95.5  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2190  dihydrodipicolinate synthase  27.69 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0039  N-acetylneuraminate lyase, putative  26.5 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2144  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 		 327 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00221445  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  30.14 
 
 		 290 aa  92.8  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  26.86 
 
 		 291 aa  92.8  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  30.14 
 
 		 290 aa  92.8  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  24.74 
 
 		 288 aa  92.4  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  25.84 
 
 		 291 aa  92.4  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  24.75 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  28.07 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  25.5 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  27.8 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6449  dihydrodipicolinate synthetase  26.23 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0532  dihydrodipicolinate synthase, putative  27.89 
 
 		 302 aa  90.9  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0813  dihydrodipicolinate synthetase  24.56 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  27.65 
 
 		 290 aa  90.1  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  24.58 
 
 		 292 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 		 303 aa  89.4  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  25.77 
 
 		 292 aa  89.4  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3573  dihydrodipicolinate synthetase  29.58 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.283076  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1620  dihydrodipicolinate synthetase  28.32 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6272  dihydrodipicolinate synthetase  27.21 
 
 		 301 aa  89.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  27.43 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  23.63 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  27.3 
 
 		 290 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  29.6 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1453  putative dihydrodipicolinate synthase  27.71 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  26.92 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  29.01 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  26.41 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 		 294 aa  87  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  24.74 
 
 		 297 aa  87  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  27.34 
 
 		 293 aa  86.7  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  28.92 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2280  dihydrodipicolinate synthetase  27.15 
 
 		 306 aa  86.7  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0107583  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5807  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  25.68 
 
 		 302 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>