More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1946 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1946  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 305 aa  632  1e-180  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191392  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3023  dihydrodipicolinate synthetase  40.6 
 
 		 313 aa  223  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3256  dihydrodipicolinate synthetase  39.13 
 
 		 314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0185396  normal  0.0566926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2625  dihydrodipicolinate synthetase  42.81 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2213  N-acetylneuraminate lyase  40.6 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1374  dihydrodipicolinate synthetase family protein  37.84 
 
 		 298 aa  202  8e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0899  dihydropicolinate synthase  36.7 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.442458  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1522  dihydrodipicolinate synthetase  36.36 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2063  N-acetylneuraminate lyase  35.45 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000571385  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1400  dihydrodipicolinate synthetase  36.08 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.13834  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2776  putative N-acetylneuraminate lyase  36.08 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216717 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1293  putative N-acetylneuraminate lyase  36.08 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.519377  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  31.49 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  31.49 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  31.49 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  31.49 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  31.49 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  31.49 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  31.49 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  31.49 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  31.49 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  30.3 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  30.3 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  30.3 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  30.3 
 
 		 297 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  30.3 
 
 		 297 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.05 
 
 		 313 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3832  N-acetylneuraminate lyase  29.01 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3661  N-acetylneuraminate lyase  29.69 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.529009  normal  0.169481 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  29.55 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0175  N-acetylneuraminate lyase  27.3 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  27.78 
 
 		 288 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  27.99 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2103  dihydrodipicolinate synthase  29.07 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  0.145144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2116  dihydrodipicolinate synthase  29.07 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2162  dihydrodipicolinate synthase  29.07 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3452  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1047  N-acetylneuraminate lyase  29.53 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  29.18 
 
 		 295 aa  102  8e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  26.35 
 
 		 289 aa  102  8e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0695  N-acetylneuraminate lyase  30.07 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  30.43 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  26.69 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3485  dihydrodipicolinate synthetase  28.89 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  25.76 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  26.35 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0298  N-acetylneuraminate lyase  27.84 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0305  N-acetylneuraminate lyase  27.84 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  28.97 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  28.66 
 
 		 302 aa  99.8  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  25.17 
 
 		 293 aa  99.4  7e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  27.84 
 
 		 288 aa  99  8e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1388  dihydrodipicolinate synthetase  29.86 
 
 		 287 aa  99  8e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.459727  normal  0.509229 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  26.51 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0951  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1347  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 		 308 aa  97.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0665282  decreased coverage  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 294 aa  97.4  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1273  dihydrodipicolinate synthase  27.72 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  29.15 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  28.86 
 
 		 297 aa  95.9  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  31.69 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  29.55 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  28.19 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  27.95 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  27.95 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  27.4 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  27.94 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1389  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  28.14 
 
 		 297 aa  92.8  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  27.57 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  26.28 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1453  putative dihydrodipicolinate synthase  29.67 
 
 		 302 aa  92.4  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  27.12 
 
 		 294 aa  92.4  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  28.76 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  25.84 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  27.3 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07150  dihydrodipicolinate synthase  28.91 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.152758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  29.55 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  26.35 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  26.62 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 		 314 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  29.52 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  28.09 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  28.86 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0415  N-acetylneuraminate lyase  29.08 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.275578  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  29.39 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2156  dihydrodipicolinate synthetase  25.94 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  30.83 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7523  dihydrodipicolinate synthase  27.59 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2144  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 		 327 aa  90.1  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00221445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  28.18 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  26.47 
 
 		 290 aa  89.7  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  27.33 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 290 aa  89.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  28.17 
 
 		 323 aa  89.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>