More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1388 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1388  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 287 aa  578  1e-164  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.459727  normal  0.509229 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0934  dihydrodipicolinate synthetase  47.39 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.090977  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1296  2-keto-3-deoxygalactonate aldolase / 2-keto-3-deoxy-phosphogalactonate aldolase / 2-keto-3-deoxy-phosphogluconate aldolase / 2-keto-3-deoxygluconate aldolase  45.52 
 
 		 289 aa  255  7e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0935  dihydrodipicolinate synthetase  33.57 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1620  dihydrodipicolinate synthetase  29.86 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  30.61 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3832  N-acetylneuraminate lyase  27.3 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  33.79 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 298 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 298 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 298 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  31.65 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  26.58 
 
 		 290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  30.6 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  29.2 
 
 		 302 aa  109  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  30.96 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  27.78 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  27.89 
 
 		 301 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0415  N-acetylneuraminate lyase  31.7 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.275578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  29.72 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3661  N-acetylneuraminate lyase  28.4 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.529009  normal  0.169481 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  28.4 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  28.4 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  28.4 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  28.4 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  28.4 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  28.4 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1875  dihydrodipicolinate synthase  27.62 
 
 		 288 aa  105  9e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  26.6 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2222  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  27.15 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4291  dihydrodipicolinate synthetase  29.55 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0396513 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  27.97 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  28.35 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.29 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1047  N-acetylneuraminate lyase  25.69 
 
 		 309 aa  102  6e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  28.12 
 
 		 295 aa  102  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  28.87 
 
 		 305 aa  102  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  30.6 
 
 		 290 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  30.84 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  26.75 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  26.69 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  28 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  26.75 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  26.75 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  26.75 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  26.75 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  26.75 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  26.75 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  26.75 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3604  dihydrodipicolinate synthetase  28.07 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  28.37 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  26.75 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0298  N-acetylneuraminate lyase  25.44 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0305  N-acetylneuraminate lyase  25.44 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  29.02 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  30.13 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  28.97 
 
 		 292 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  28.97 
 
 		 292 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1946  dihydrodipicolinate synthetase  29.86 
 
 		 305 aa  99  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191392  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  28.97 
 
 		 292 aa  99  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  28.97 
 
 		 292 aa  99  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  28.97 
 
 		 292 aa  99  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  28.97 
 
 		 292 aa  99  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  28.22 
 
 		 298 aa  99  8e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  28.97 
 
 		 292 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 289 aa  99  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  28.97 
 
 		 292 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  27.78 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  29.05 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.41 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  27.55 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  28.17 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2190  dihydrodipicolinate synthase  31.64 
 
 		 314 aa  98.2  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  25.96 
 
 		 289 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1978  dihydrodipicolinate synthetase  26.46 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.578395  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2063  dihydrodipicolinate synthase  28.25 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1265  dihydrodipicolinate synthetase  27.27 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  27.42 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  25.62 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  25.96 
 
 		 289 aa  96.3  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4110  dihydrodipicolinate synthetase  25.68 
 
 		 297 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  30.4 
 
 		 326 aa  96.3  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3485  dihydrodipicolinate synthetase  24.83 
 
 		 289 aa  95.9  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  25.1 
 
 		 298 aa  94.7  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  30.22 
 
 		 291 aa  94.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  27.46 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2156  dihydrodipicolinate synthetase  28.03 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  25.9 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  29.23 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  27.84 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  25.69 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  27.84 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.503779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>