More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3604 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3604  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 292 aa  593  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4291  dihydrodipicolinate synthetase  85.27 
 
 		 295 aa  511  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0396513 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1818  dihydrodipicolinate synthetase  49.64 
 
 		 301 aa  263  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7655  dihydrodipicolinate synthetase  40.07 
 
 		 307 aa  168  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.374568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1483  dihydrodipicolinate synthetase  37.46 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4114  dihydrodipicolinate synthetase  34.48 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6272  dihydrodipicolinate synthetase  34.97 
 
 		 301 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2209  dihydrodipicolinate synthetase  34.41 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5202  dihydrodipicolinate synthetase  40 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.001593  normal  0.0809997 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8129  dihydrodipicolinate synthetase  35.4 
 
 		 306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6449  dihydrodipicolinate synthetase  33.92 
 
 		 300 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1463  dihydrodipicolinate synthetase  36.82 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0469  dihydrodipicolinate synthetase  33.1 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.93303  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0325  dihydrodipicolinate synthetase  35.71 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3814  dihydrodipicolinate synthetase  35.04 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6264  dihydrodipicolinate synthetase  34.84 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0359  dihydrodipicolinate synthetase  31.8 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5466  dihydrodipicolinate synthetase  31.29 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.97097  normal  0.383759 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  29.23 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3748  dihydrodipicolinate synthetase  37.16 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5196  dihydrodipicolinate synthetase  31.03 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.608528  normal  0.0925463 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1485  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1456  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  27.53 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  30.24 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  31.38 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  33.7 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  31.83 
 
 		 293 aa  113  5e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  35.29 
 
 		 291 aa  112  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  27.86 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3219  dihydrodipicolinate synthase  33.68 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  30.53 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  27.86 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  30.58 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  35.56 
 
 		 294 aa  109  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  29.35 
 
 		 292 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  35.09 
 
 		 332 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  31.77 
 
 		 291 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  30.14 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  30.14 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  31.17 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  29.79 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  27.87 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  28.27 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  29.97 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  26.21 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  28.03 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  27.84 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0965  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1251  dihydrodipicolinate synthase  32.3 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1978  dihydrodipicolinate synthetase  32.63 
 
 		 296 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.578395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.56 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  29.55 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  28.17 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21211  dihydrodipicolinate synthase  31.96 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1335  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.95 
 
 		 313 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.106036 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  31.25 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17791  dihydrodipicolinate synthetase  33.22 
 
 		 302 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2439  dihydrodipicolinate synthetase  33.09 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  29.31 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  29.79 
 
 		 292 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  29.79 
 
 		 292 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  32.5 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2177  dihydrodipicolinate synthase  29.07 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474227  normal  0.485402 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0257  dihydrodipicolinate synthase  29.15 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.457936  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  32.25 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  26.74 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.07 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 		 291 aa  102  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  30.93 
 
 		 297 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  29.79 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  29.79 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  29.79 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  29.79 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0556  dihydrodipicolinate synthetase  33.73 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  29.79 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  32.03 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  29.79 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  32.59 
 
 		 319 aa  102  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  28.28 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 289 aa  102  9e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  31.3 
 
 		 295 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  29.32 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  28.83 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1388  dihydrodipicolinate synthetase  28.07 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.459727  normal  0.509229 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  30.92 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3758  dihydrodipicolinate synthetase  32.86 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  28.37 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  31.3 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2658  dihydrodipicolinate synthase  33.94 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28394  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>