More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4291 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4291  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 295 aa  597  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0396513 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3604  dihydrodipicolinate synthetase  85.27 
 
 		 292 aa  511  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1818  dihydrodipicolinate synthetase  46.71 
 
 		 301 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7655  dihydrodipicolinate synthetase  38.33 
 
 		 307 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.374568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1483  dihydrodipicolinate synthetase  34.81 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5202  dihydrodipicolinate synthetase  34.59 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.001593  normal  0.0809997 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4114  dihydrodipicolinate synthetase  36.4 
 
 		 299 aa  145  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2209  dihydrodipicolinate synthetase  34.31 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0325  dihydrodipicolinate synthetase  35.93 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3814  dihydrodipicolinate synthetase  35.13 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0469  dihydrodipicolinate synthetase  31.36 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.93303  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6272  dihydrodipicolinate synthetase  33.45 
 
 		 301 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6449  dihydrodipicolinate synthetase  33.11 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8129  dihydrodipicolinate synthetase  32.86 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1463  dihydrodipicolinate synthetase  34.09 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0359  dihydrodipicolinate synthetase  32.51 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6264  dihydrodipicolinate synthetase  35.29 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  28.12 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1485  dihydrodipicolinate synthase  30.42 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1456  dihydrodipicolinate synthase  30.42 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5196  dihydrodipicolinate synthetase  31.1 
 
 		 294 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.608528  normal  0.0925463 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3748  dihydrodipicolinate synthetase  35.68 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  29.23 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5466  dihydrodipicolinate synthetase  29.62 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.97097  normal  0.383759 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  32.28 
 
 		 293 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  30.1 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  27.37 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  27.37 
 
 		 291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  30.98 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  30.85 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  30.85 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  32.43 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  31.27 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  28.37 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  35.24 
 
 		 294 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  32.86 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  28.03 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  34.75 
 
 		 292 aa  105  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  30.58 
 
 		 291 aa  105  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  32.99 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1388  dihydrodipicolinate synthetase  29.55 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.459727  normal  0.509229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  28.9 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2387  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2439  dihydrodipicolinate synthetase  33.09 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  28.87 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  29.25 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  28.87 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0965  dihydrodipicolinate synthase  27.4 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  26.55 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  26.13 
 
 		 293 aa  102  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  25.52 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0257  dihydrodipicolinate synthase  27.7 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.457936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  30.32 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  27.97 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2190  dihydrodipicolinate synthase  34.25 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3219  dihydrodipicolinate synthase  32.75 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  32.48 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  32.14 
 
 		 300 aa  99.8  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  29.11 
 
 		 292 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2643  dihydrodipicolinate synthase  32.07 
 
 		 316 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3758  dihydrodipicolinate synthetase  33.81 
 
 		 295 aa  99.8  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 292 aa  99.4  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  31.03 
 
 		 319 aa  99  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2614  dihydrodipicolinate synthase  32.07 
 
 		 316 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2658  dihydrodipicolinate synthase  32.07 
 
 		 316 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  30.72 
 
 		 297 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  27.9 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2103  dihydrodipicolinate synthase  32.65 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  0.145144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  26.64 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  27.9 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  31.33 
 
 		 307 aa  98.2  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3191  dihydrodipicolinate synthase  32.63 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0102406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  31.74 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  34.82 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  29.55 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1978  dihydrodipicolinate synthetase  31.71 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.578395  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  27.93 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  29.66 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  29.45 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2116  dihydrodipicolinate synthase  32.31 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2162  dihydrodipicolinate synthase  32.31 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3452  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  27.68 
 
 		 292 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7523  dihydrodipicolinate synthase  30.69 
 
 		 304 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  27.68 
 
 		 292 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  24.57 
 
 		 289 aa  96.3  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1251  dihydrodipicolinate synthase  31.69 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  34.47 
 
 		 298 aa  96.3  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  31 
 
 		 295 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  30.69 
 
 		 294 aa  95.9  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  33.19 
 
 		 294 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>