More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0325 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0325  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 310 aa  611  9.999999999999999e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6449  dihydrodipicolinate synthetase  46.55 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6272  dihydrodipicolinate synthetase  46.21 
 
 		 301 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8129  dihydrodipicolinate synthetase  46.69 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1463  dihydrodipicolinate synthetase  46.82 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1483  dihydrodipicolinate synthetase  42.62 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3814  dihydrodipicolinate synthetase  42.18 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5202  dihydrodipicolinate synthetase  40.83 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.001593  normal  0.0809997 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6264  dihydrodipicolinate synthetase  44.56 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4114  dihydrodipicolinate synthetase  42.52 
 
 		 299 aa  226  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0469  dihydrodipicolinate synthetase  40.69 
 
 		 308 aa  221  9e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.93303  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7655  dihydrodipicolinate synthetase  42.76 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.374568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2209  dihydrodipicolinate synthetase  38.24 
 
 		 311 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5466  dihydrodipicolinate synthetase  34.27 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.97097  normal  0.383759 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5196  dihydrodipicolinate synthetase  33.92 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.608528  normal  0.0925463 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3748  dihydrodipicolinate synthetase  38.91 
 
 		 287 aa  168  9e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3758  dihydrodipicolinate synthetase  36.55 
 
 		 295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0359  dihydrodipicolinate synthetase  33.21 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4291  dihydrodipicolinate synthetase  35.93 
 
 		 295 aa  148  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0396513 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3604  dihydrodipicolinate synthetase  35.71 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1818  dihydrodipicolinate synthetase  35.29 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  35.48 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  35.08 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  35.08 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  33.47 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  33.87 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.06 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  32.38 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  34.87 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  30.58 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  33.6 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  32.56 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  31.33 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  35.86 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  31 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  29.39 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  30.49 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  33.55 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  30.19 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  33.66 
 
 		 296 aa  106  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  30.41 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.07 
 
 		 301 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  31.56 
 
 		 293 aa  105  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  30.33 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  35.05 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  33.85 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1335  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  35.02 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.106036 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  30.52 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1666  dihydrodipicolinate synthase  30.33 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.458011  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  27.52 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07550  dihydrodipicolinate synthase  29.01 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.02513  normal  0.756847 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  32.65 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  33.85 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  31.34 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  31.44 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  33.85 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  32.33 
 
 		 292 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3191  dihydrodipicolinate synthase  33.7 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0102406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 		 298 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  30.2 
 
 		 296 aa  102  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  30.58 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  32.33 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  33.46 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  30.15 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  31.52 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  31.84 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  31.4 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  33.2 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0678  dihydrodipicolinate synthase  32.27 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  30.45 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2063  dihydrodipicolinate synthase  27.63 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  33.08 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10990  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G01230)  34.14 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.632433 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00617  conserved hypothetical protein  31.54 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.111559  normal  0.483621 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3841  dihydrodipicolinate synthetase  28.15 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.308055 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  29.7 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  29.67 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3733  dihydrodipicolinate synthetase  28.15 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3902  dihydrodipicolinate synthetase  28.15 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  31.85 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3799  dihydrodipicolinate synthetase  28.15 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  33.11 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  33.11 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  31.33 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0530  dihydrodipicolinate synthase  30.2 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.4261 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  34.22 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1063  dihydrodipicolinate synthase, putative  25.86 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  27.87 
 
 		 298 aa  99.4  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  31.77 
 
 		 323 aa  99.4  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  31.54 
 
 		 294 aa  99  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  29.45 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  34.2 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  35.62 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  31.06 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>