More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1296 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1296  2-keto-3-deoxygalactonate aldolase / 2-keto-3-deoxy-phosphogalactonate aldolase / 2-keto-3-deoxy-phosphogluconate aldolase / 2-keto-3-deoxygluconate aldolase  100 
 
 		 289 aa  592  1e-168  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0934  dihydrodipicolinate synthetase  50.54 
 
 		 294 aa  285  9e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.090977  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1388  dihydrodipicolinate synthetase  45.52 
 
 		 287 aa  255  7e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.459727  normal  0.509229 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0935  dihydrodipicolinate synthetase  28.08 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  31.1 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  27.72 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1620  dihydrodipicolinate synthetase  25.61 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  29.69 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1265  dihydrodipicolinate synthetase  28.97 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2280  dihydrodipicolinate synthetase  28.36 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0107583  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0090  Dihydrodipicolinate synthase  27.89 
 
 		 289 aa  103  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  29.02 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  26.59 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0175  N-acetylneuraminate lyase  26.5 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2190  dihydrodipicolinate synthase  29.03 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0305  N-acetylneuraminate lyase  27.96 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0298  N-acetylneuraminate lyase  27.96 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  29.07 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  25.09 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1199  dihydrodipicolinate synthase  26.3 
 
 		 321 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3661  N-acetylneuraminate lyase  26.43 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.529009  normal  0.169481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2144  dihydrodipicolinate synthase  25.53 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00221445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0309  dihydrodipicolinate synthetase  27.27 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  24.74 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  24.74 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0556  dihydrodipicolinate synthetase  27.51 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  28.02 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  24.74 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  24.74 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  24.74 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  24.74 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  24.74 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  28.23 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  24.74 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1812  dihydrodipicolinate synthetase  28.38 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.973565  normal  0.703771 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2387  dihydrodipicolinate synthase  25.98 
 
 		 303 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117065 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  26.01 
 
 		 297 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  28 
 
 		 303 aa  95.5  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3832  N-acetylneuraminate lyase  26.67 
 
 		 302 aa  95.5  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  30.53 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  26.01 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3989  dihydrodipicolinate synthetase  30.82 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  26.01 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  26.01 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  26.01 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  26.72 
 
 		 305 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.33 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3544  dihydrodipicolinate synthase  27.62 
 
 		 352 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.136616  normal  0.330927 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  28.72 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1347  dihydrodipicolinate synthase  27.72 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0665282  decreased coverage  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2538  dihydrodipicolinate synthase  29.31 
 
 		 298 aa  93.2  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.127413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1479  dihydrodipicolinate synthase  29.15 
 
 		 308 aa  93.2  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205213  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  28.37 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  29.47 
 
 		 295 aa  93.2  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  26.57 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0774  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 		 292 aa  93.2  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.392848  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  26.44 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0992  dihydrodipicolinate synthetase  27.4 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.673974  hitchhiker  0.00851435 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  29.82 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  29.33 
 
 		 308 aa  92.8  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2116  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 303 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2103  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 303 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  0.145144 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2162  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 303 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3452  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6633  dihydrodipicolinate synthase  28.09 
 
 		 292 aa  92.4  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  29.87 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1389  dihydrodipicolinate synthase  28.94 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  26.16 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  26.3 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  28.36 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  25.75 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4000  dihydrodipicolinate synthase  25.81 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0415  N-acetylneuraminate lyase  27.84 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.275578  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  25.26 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  29.15 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1666  dihydrodipicolinate synthase  28.48 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.458011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  26.22 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  26.22 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  26.22 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  29.33 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  26.22 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  26.22 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  26.22 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  26.22 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  26.22 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4823  dihydrodipicolinate synthetase  25.8 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0718726  normal  0.342199 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0695  N-acetylneuraminate lyase  26.79 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  27.46 
 
 		 294 aa  89.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1312  dihydrodipicolinate synthase  29.28 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.344915 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  26.57 
 
 		 341 aa  89.7  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2156  dihydrodipicolinate synthetase  26.28 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  27.8 
 
 		 295 aa  89.4  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  27.11 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  24.65 
 
 		 298 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  26.87 
 
 		 296 aa  89  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5112  dihydrodipicolinate synthase  29.28 
 
 		 296 aa  89  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09438  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 		 292 aa  89  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7859  dihydrodipicolinate synthase  28.91 
 
 		 308 aa  89  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 305 aa  89  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>