More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2739 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2739  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 312 aa  628  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145378  normal  0.165925 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  31.91 
 
 		 293 aa  133  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  29.35 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  33.01 
 
 		 298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  33.92 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  34.01 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  32 
 
 		 291 aa  126  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  30.33 
 
 		 291 aa  125  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  29.59 
 
 		 292 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3845  dihydrodipicolinate synthetase  29.43 
 
 		 299 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  30.99 
 
 		 292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5022  dihydrodipicolinate synthetase  31.6 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4039  dihydrodipicolinate synthetase  31.6 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  30.95 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3972  dihydrodipicolinate synthetase  31.49 
 
 		 299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  30.13 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3930  dihydrodipicolinate synthetase  31.25 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  37.58 
 
 		 304 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  28.05 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  28.91 
 
 		 292 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  29.57 
 
 		 291 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  32.86 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  35.98 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  29.64 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  37.58 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4989  dihydrodipicolinate synthetase  30.72 
 
 		 299 aa  116  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  31.63 
 
 		 296 aa  116  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  26.37 
 
 		 297 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  37.58 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3944  dihydrodipicolinate synthase  33.11 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3957  dihydrodipicolinate synthetase  28.25 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  35.98 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  31.34 
 
 		 294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  31.33 
 
 		 290 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  27.72 
 
 		 298 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  31.34 
 
 		 294 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  31.33 
 
 		 295 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  30.42 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  35.76 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  26.33 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4841  dihydrodipicolinate synthase  27 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00571792 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  34.73 
 
 		 294 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  36.36 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  35.2 
 
 		 292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  25.33 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  36.36 
 
 		 292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  31.85 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  36.53 
 
 		 291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  30.67 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  25.17 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  30.82 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  34.55 
 
 		 313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  23.03 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  31.85 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  30.97 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  32.93 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  29.14 
 
 		 291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.28 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3237  dihydrodipicolinate synthase  29.84 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115638  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  27.53 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  34.55 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  34.15 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1702  dihydrodipicolinate synthase  28.33 
 
 		 294 aa  109  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000467042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  30.33 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1864  dihydrodipicolinate synthase  32.73 
 
 		 294 aa  109  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000003415  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  27.78 
 
 		 298 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4110  dihydrodipicolinate synthetase  32.32 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  23.75 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  23.75 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  23.75 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  23.75 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  23.75 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  35.58 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  23.75 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  23.75 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  28.39 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  29.29 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  33.74 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  23.75 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  26.67 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  30.28 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  25.84 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  27.74 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  25.84 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  28.91 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  27.42 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  34.36 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  34.15 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  26.07 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  31.94 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>