227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3526 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3526  degV family protein  100 
 
 
278 aa  537  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3599  degV family protein  100 
 
 
278 aa  537  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3531  degV family protein  99.64 
 
 
278 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.766898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3922  degV family protein  72.33 
 
 
277 aa  354  7.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2657  degV family protein  73.91 
 
 
282 aa  350  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.108706  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12445  hypothetical protein  64.75 
 
 
280 aa  296  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3190  degV family protein  47.83 
 
 
286 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  43.73 
 
 
280 aa  175  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  44.44 
 
 
296 aa  166  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  43.93 
 
 
284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2804  degV family protein  38.55 
 
 
279 aa  152  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  36.2 
 
 
283 aa  148  9e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  36.79 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3849  degV family protein  42.63 
 
 
286 aa  145  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3470  degV family protein  45.3 
 
 
286 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.748591  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  27.4 
 
 
279 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  28.88 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6798  degV family protein  39.85 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  29.02 
 
 
283 aa  124  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17350  degV family protein  37.05 
 
 
322 aa  123  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173682  hitchhiker  0.00667437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2272  hypothetical protein  36.33 
 
 
282 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  27.6 
 
 
282 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2246  degV family protein  33.91 
 
 
297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  28.42 
 
 
279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  28.42 
 
 
279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  30.14 
 
 
279 aa  118  9e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  36.08 
 
 
286 aa  117  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  30.85 
 
 
279 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  26.26 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  28.47 
 
 
279 aa  117  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  29.29 
 
 
282 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  34.98 
 
 
284 aa  116  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  28.47 
 
 
279 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  27.76 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1983  degV family protein  35.19 
 
 
331 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  27.21 
 
 
285 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  29.17 
 
 
283 aa  115  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  31.56 
 
 
279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  26.95 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0620  DegV family protein  27.76 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  33.45 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  30.18 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  30.28 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  27.54 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  28.47 
 
 
281 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  28.11 
 
 
279 aa  108  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  29.9 
 
 
281 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  28.37 
 
 
292 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  27.46 
 
 
311 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  27.84 
 
 
281 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  30.14 
 
 
282 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  27.82 
 
 
310 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  27.76 
 
 
279 aa  106  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  27.08 
 
 
280 aa  105  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  27.11 
 
 
311 aa  105  9e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28270  degV family protein  30.47 
 
 
279 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  29.39 
 
 
282 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  25.63 
 
 
284 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  27.21 
 
 
280 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  26.13 
 
 
281 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1014  hypothetical protein  26.95 
 
 
282 aa  102  7e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  31.16 
 
 
282 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  30.88 
 
 
280 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  25.61 
 
 
280 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  25.44 
 
 
280 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0416  DegV family protein  28.21 
 
 
288 aa  100  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  23.79 
 
 
299 aa  99.8  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0773  degV family protein  25.74 
 
 
288 aa  99.4  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  25.74 
 
 
288 aa  99.4  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  33.81 
 
 
271 aa  98.6  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  32.86 
 
 
285 aa  98.6  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  22.46 
 
 
292 aa  98.6  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12470  degV family protein  34.05 
 
 
324 aa  98.2  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.403372  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  25 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  26.41 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  26.33 
 
 
280 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  25.44 
 
 
281 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  26.57 
 
 
279 aa  96.7  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  27.56 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  26.57 
 
 
279 aa  96.3  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1032  degV family protein  26.86 
 
 
284 aa  95.9  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.185654  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  22.74 
 
 
281 aa  95.9  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  23.24 
 
 
293 aa  95.9  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  23.1 
 
 
281 aa  95.5  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  24.13 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2216  degV family protein  39.18 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202222  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  33.51 
 
 
287 aa  94  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  25.53 
 
 
282 aa  93.2  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0022  degV family protein  24.15 
 
 
288 aa  92.4  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.314645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  24.1 
 
 
290 aa  92.4  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0362  degV family protein  23.96 
 
 
288 aa  92  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  27.14 
 
 
287 aa  91.3  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0171  DegV family protein  29.7 
 
 
276 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1644  degV family protein  26.52 
 
 
604 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.524877  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0600  degV family protein  29.75 
 
 
683 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100467 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  23.94 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  23.86 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  29.5 
 
 
277 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6052  degV family protein  34.06 
 
 
280 aa  90.1  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  23.84 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>