229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6052 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6052  degV family protein  100 
 
 		 280 aa  533  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28270  degV family protein  54.71 
 
 		 279 aa  279  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2272  hypothetical protein  48.21 
 
 		 282 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  45.16 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  47.86 
 
 		 284 aa  184  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6798  degV family protein  44.03 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  42.24 
 
 		 326 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  47.1 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2246  degV family protein  42.25 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  44.4 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  30.71 
 
 		 279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3849  degV family protein  42.39 
 
 		 286 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1983  degV family protein  39.79 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179481 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12470  degV family protein  41.05 
 
 		 324 aa  135  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.403372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  32.01 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  35.94 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  29.5 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  28.83 
 
 		 282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  32.01 
 
 		 279 aa  132  5e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  32 
 
 		 279 aa  132  5e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  41.3 
 
 		 284 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  27.86 
 
 		 282 aa  129  8.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3190  degV family protein  36 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  31.82 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3470  degV family protein  41.45 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.748591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  36.36 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  30.25 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  29.5 
 
 		 283 aa  122  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  29.39 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  27.21 
 
 		 293 aa  118  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  27.97 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  25.44 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  30.04 
 
 		 283 aa  116  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  28.57 
 
 		 283 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  26.98 
 
 		 287 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  30.5 
 
 		 286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  29.25 
 
 		 282 aa  115  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  28.52 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  27.7 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  28.21 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  30.47 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  29.54 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  27.86 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  30.31 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  27.34 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  27.34 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  27.4 
 
 		 281 aa  112  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  29.14 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  31.8 
 
 		 282 aa  112  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  28.57 
 
 		 281 aa  112  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  33.92 
 
 		 282 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  30.88 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  27.34 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  27.34 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  27.34 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  29.58 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  27.44 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  28.67 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  27.34 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  27.34 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  27.34 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  29.43 
 
 		 279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  36.27 
 
 		 286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  27.34 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17350  degV family protein  34.63 
 
 		 322 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173682  hitchhiker  0.00667437 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  27.86 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  25.54 
 
 		 281 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  26.6 
 
 		 284 aa  108  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2216  degV family protein  42.29 
 
 		 282 aa  108  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202222  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  30.5 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  32.5 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  31.21 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  30.24 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  29.18 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  28.93 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0150  degV family protein  26.92 
 
 		 833 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1644  degV family protein  31.23 
 
 		 604 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.524877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  25.18 
 
 		 281 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  28.52 
 
 		 286 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  28.16 
 
 		 286 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  28.16 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  28.16 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  28.16 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  28.16 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  28.16 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3526  degV family protein  34.06 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  28.82 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3599  degV family protein  34.06 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3531  degV family protein  34.06 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.766898 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  27.8 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  28.16 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  31.32 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  27.72 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  27.34 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  28.82 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  28.47 
 
 		 287 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  28.47 
 
 		 287 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  28.47 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  25.26 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  27.08 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>