229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2657 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2657  degV family protein  100 
 
 
282 aa  551  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.108706  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3922  degV family protein  85.98 
 
 
277 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3526  degV family protein  73.19 
 
 
278 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3599  degV family protein  73.19 
 
 
278 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3531  degV family protein  73.19 
 
 
278 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.766898 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12445  hypothetical protein  61.59 
 
 
280 aa  280  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3190  degV family protein  46.72 
 
 
286 aa  208  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  45.88 
 
 
280 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  44.41 
 
 
284 aa  168  8e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  40.28 
 
 
283 aa  167  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2804  degV family protein  38.32 
 
 
279 aa  155  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  35.69 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  41.73 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3849  degV family protein  39.44 
 
 
286 aa  139  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3470  degV family protein  41.45 
 
 
286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.748591  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  28.32 
 
 
282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2272  hypothetical protein  36.59 
 
 
282 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  35.44 
 
 
284 aa  122  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  34.62 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6798  degV family protein  35.51 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17350  degV family protein  36.43 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173682  hitchhiker  0.00667437 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2246  degV family protein  34.77 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  29.18 
 
 
293 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  30.6 
 
 
282 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  29.33 
 
 
281 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  28.42 
 
 
283 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  27.66 
 
 
285 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  34.15 
 
 
280 aa  105  6e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  27.53 
 
 
292 aa  105  6e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  23.61 
 
 
279 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  25.45 
 
 
283 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  26.26 
 
 
281 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  28.77 
 
 
283 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  30 
 
 
279 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  29.33 
 
 
279 aa  102  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  26.86 
 
 
281 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  28.77 
 
 
283 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1983  degV family protein  34.12 
 
 
331 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179481 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  26.71 
 
 
284 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  25 
 
 
279 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  27.24 
 
 
280 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  25 
 
 
279 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  27.62 
 
 
280 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  24.64 
 
 
282 aa  99.8  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  27.62 
 
 
281 aa  99.8  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  27.72 
 
 
279 aa  99.8  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  28.52 
 
 
279 aa  99.4  6e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  27.56 
 
 
279 aa  99  9e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  28.42 
 
 
281 aa  99  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  26.55 
 
 
310 aa  98.6  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  27.05 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28270  degV family protein  30.69 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1014  hypothetical protein  27.66 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  28.17 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  29.12 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  26.09 
 
 
282 aa  96.7  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  27.68 
 
 
284 aa  96.3  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  28.17 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  25.44 
 
 
311 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  29.43 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  23.34 
 
 
293 aa  94  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  25.52 
 
 
311 aa  93.6  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  32.62 
 
 
271 aa  93.6  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0600  degV family protein  29.64 
 
 
683 aa  92.4  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100467 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0022  degV family protein  22.6 
 
 
288 aa  92.4  8e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.314645  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0362  degV family protein  25.26 
 
 
288 aa  92  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  28.37 
 
 
281 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  25.44 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  24.38 
 
 
280 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  24.03 
 
 
280 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1644  degV family protein  26.88 
 
 
604 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.524877  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12470  degV family protein  32.43 
 
 
324 aa  90.5  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.403372  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  28.27 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  24.38 
 
 
280 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  23.67 
 
 
280 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  24.38 
 
 
280 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  31.34 
 
 
285 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  24.38 
 
 
280 aa  90.1  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  24.38 
 
 
280 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  23.67 
 
 
280 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0171  DegV family protein  29.45 
 
 
276 aa  89.7  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  27.4 
 
 
282 aa  89.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  24.38 
 
 
280 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  27.85 
 
 
282 aa  88.6  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  25.35 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2216  degV family protein  38.78 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202222  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  33.46 
 
 
282 aa  87  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  25.69 
 
 
285 aa  87  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  26.24 
 
 
285 aa  87  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  26.69 
 
 
282 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  29.24 
 
 
287 aa  86.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  27.24 
 
 
287 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  23.51 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  29.93 
 
 
282 aa  86.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  26.79 
 
 
280 aa  85.5  8e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0773  degV family protein  24.73 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  24.73 
 
 
280 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  24.73 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  25.35 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  22.26 
 
 
280 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>