More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0600 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1644  degV family protein  59.71 
 
 
604 aa  748    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.524877  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0600  degV family protein  100 
 
 
683 aa  1385    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100467 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  69.39 
 
 
637 aa  842    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0263  hypothetical protein  28.64 
 
 
595 aa  265  3e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0258  hypothetical protein  28.32 
 
 
595 aa  264  4e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0150  degV family protein  37.8 
 
 
833 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2785  Dak phosphatase  37.65 
 
 
532 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0307198  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1985  DAK2 domain-containing protein  34.93 
 
 
548 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1703  DAK2 domain-containing protein  34.43 
 
 
548 aa  198  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2995  DAK2 domain fusion protein YloV  37.81 
 
 
533 aa  195  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1742  Dak phosphatase  33.94 
 
 
533 aa  195  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000219907  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1163  Dak phosphatase  32.15 
 
 
569 aa  189  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000503094  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1854  hypothetical protein  35.71 
 
 
555 aa  188  3e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0740744  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0770  dihydroxyacetone kinase-like protein  33.75 
 
 
554 aa  187  4e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000515154  hitchhiker  0.00000000543128 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf741  predicted kinase, related to dihydroxyacetone kinase  35.2 
 
 
546 aa  187  5e-46  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1285  hypothetical protein  32.72 
 
 
548 aa  187  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00246174  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1310  hypothetical protein  32.72 
 
 
548 aa  187  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.031715  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1074  Dak phosphatase  36.92 
 
 
544 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394309  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0448  dihydroxyacetone kinase-like protein  32.77 
 
 
554 aa  184  3e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0178919  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1263  DAK2 domain-containing protein  36.62 
 
 
544 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000174743  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1060  Dak phosphatase  34.47 
 
 
528 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000112425  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1046  DAK2 domain protein  36 
 
 
544 aa  184  6e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000946454  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1074  Dak phosphatase  33.64 
 
 
558 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0587558  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1430  degV family protein  34.74 
 
 
827 aa  182  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0131  DAK2 domain-containing protein  34.48 
 
 
543 aa  183  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1052  Dak phosphatase  34.58 
 
 
528 aa  182  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0792  DAK2 domain-containing protein  33.15 
 
 
552 aa  181  4.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3870  putative phosphatase  32.29 
 
 
558 aa  178  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5430699999999999e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3707  phosphatase  32.29 
 
 
558 aa  178  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0785111  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3597  dihydroxyacetone-related kinase  32.29 
 
 
558 aa  178  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00426052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3994  phosphatase  32.29 
 
 
558 aa  178  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000202396  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1515  Dak phosphatase  32.19 
 
 
537 aa  177  4e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1345  Dak phosphatase  32.72 
 
 
554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.472978  normal  0.102609 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10100  Dak phosphatase  33.12 
 
 
549 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000509589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1288  putative phosphatase  32.12 
 
 
558 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156149  hitchhiker  0.000000536799 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3615  dihydroxyacetone-related kinase  31.43 
 
 
558 aa  174  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00834771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3904  putative phosphatase  31.43 
 
 
558 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000520066  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3955  putative phosphatase  32.24 
 
 
558 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00126746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3898  phosphatase, putative  31.43 
 
 
558 aa  174  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000345404  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1139  Dak phosphatase  34.98 
 
 
544 aa  174  6.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000146638  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2508  Dak phosphatase  31.88 
 
 
558 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000248731  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1964  DAK2 domain fusion protein YloV  33.94 
 
 
556 aa  173  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1223  Dak phosphatase  31.31 
 
 
546 aa  173  9e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1652  Dak phosphatase  34.42 
 
 
545 aa  172  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0196  dihydroxyacetone kinase-like protein  33.04 
 
 
554 aa  172  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0179042  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0250  Dak phosphatase  33.33 
 
 
537 aa  171  4e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1090  Dak phosphatase  33.94 
 
 
555 aa  171  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3679  Dak phosphatase  32.34 
 
 
558 aa  170  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.006144  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0759  hypothetical protein  34.15 
 
 
546 aa  170  9e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1722  Dak phosphatase  34.64 
 
 
538 aa  167  6.9999999999999995e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0961708  normal  0.0612757 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1504  dihydroxyacetone kinase-like protein  30.93 
 
 
568 aa  167  6.9999999999999995e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3837  Dak phosphatase  32.82 
 
 
560 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000220177  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1697  DAK2 domain fusion protein YloV  37.15 
 
 
518 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1271  Dak phosphatase  33.23 
 
 
537 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0365  Dak phosphatase  34.12 
 
 
545 aa  164  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0753407  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2891  Dak phosphatase  31.61 
 
 
560 aa  162  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000066683  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  30.94 
 
 
279 aa  155  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0198  DAK2 domain protein  31.74 
 
 
564 aa  154  4e-36  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0490  dihydroxyacetone kinase 2 domain-containing protein  30.6 
 
 
547 aa  151  4e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138192  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  29.43 
 
 
282 aa  151  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05580  predicted kinase, dihydroxyacetone kinase  33.74 
 
 
543 aa  150  7e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.673773  normal  0.766108 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1014  hypothetical protein  31.34 
 
 
282 aa  150  7e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1108  Dak phosphatase  34.15 
 
 
530 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.190449  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  29.64 
 
 
280 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0861  Dak phosphatase  33.44 
 
 
554 aa  149  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00152626  normal  0.95295 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  31.43 
 
 
282 aa  148  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  33.09 
 
 
284 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  25.45 
 
 
279 aa  144  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  25.45 
 
 
279 aa  144  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  25.99 
 
 
282 aa  144  6e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  30.22 
 
 
280 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  31.18 
 
 
280 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  34.42 
 
 
282 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl229  dihydroxyacetone kinase  31.29 
 
 
548 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.292481  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  28.06 
 
 
281 aa  138  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09990  predicted kinase, dihydroxyacetone kinase  33.89 
 
 
543 aa  137  7.000000000000001e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000203822  hitchhiker  0.00000373427 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  39.15 
 
 
287 aa  137  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  27.37 
 
 
280 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1369  Dak phosphatase  34.78 
 
 
526 aa  135  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0730023  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3521  Dak phosphatase  35.56 
 
 
517 aa  135  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400174  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3703  DAK2 domain fusion protein YloV  35.47 
 
 
560 aa  134  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0604  Dak phosphatase  34.06 
 
 
516 aa  133  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00036597  normal  0.583532 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1353  Dak phosphatase  31.7 
 
 
544 aa  133  9e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000477806  normal  0.2025 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  29.5 
 
 
287 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  32.5 
 
 
279 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  29.14 
 
 
280 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  29.14 
 
 
280 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  29.14 
 
 
280 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  29.14 
 
 
287 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  29.14 
 
 
287 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  32.5 
 
 
279 aa  130  6e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  28.97 
 
 
286 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  31.43 
 
 
279 aa  130  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  28.78 
 
 
280 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  29.14 
 
 
280 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1185  hypothetical protein  29.67 
 
 
277 aa  129  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  26.46 
 
 
299 aa  129  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  28.93 
 
 
282 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  28.93 
 
 
282 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1040  Dak phosphatase  35.23 
 
 
522 aa  125  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>