232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1983 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1983  degV family protein  100 
 
 
331 aa  642    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2246  degV family protein  75.26 
 
 
297 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12470  degV family protein  51.06 
 
 
324 aa  212  9e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.403372  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  44.17 
 
 
280 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6798  degV family protein  44.36 
 
 
283 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  39.58 
 
 
283 aa  176  6e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  42.76 
 
 
326 aa  175  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2272  hypothetical protein  43.9 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  47.1 
 
 
296 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  42.81 
 
 
284 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  44.48 
 
 
284 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3849  degV family protein  43.7 
 
 
286 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  40.28 
 
 
287 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3470  degV family protein  44.86 
 
 
286 aa  152  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.748591  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  35.71 
 
 
279 aa  149  6e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  35.71 
 
 
279 aa  149  6e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  34.04 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  36.04 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  34.64 
 
 
279 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6052  degV family protein  39.79 
 
 
280 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17350  degV family protein  39.63 
 
 
322 aa  140  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173682  hitchhiker  0.00667437 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  30.96 
 
 
279 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  32.37 
 
 
280 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  37.15 
 
 
282 aa  134  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  33.56 
 
 
283 aa  132  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  31.56 
 
 
280 aa  132  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  31.56 
 
 
280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  31.56 
 
 
280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  31.56 
 
 
280 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  31.56 
 
 
280 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  31.56 
 
 
280 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  34.39 
 
 
279 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  31.56 
 
 
280 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  31.21 
 
 
280 aa  129  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  31.21 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  31.21 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  33.45 
 
 
279 aa  125  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28270  degV family protein  37.14 
 
 
279 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3526  degV family protein  35.34 
 
 
278 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3599  degV family protein  35.34 
 
 
278 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3531  degV family protein  35.34 
 
 
278 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.766898 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  29.31 
 
 
282 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  34.51 
 
 
279 aa  122  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2233  degV family protein  36.55 
 
 
291 aa  122  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.956375  hitchhiker  0.00530836 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  33.81 
 
 
277 aa  122  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  28.47 
 
 
286 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  29.15 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  32.88 
 
 
299 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  29.21 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  28.14 
 
 
286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  28.14 
 
 
286 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  28.14 
 
 
286 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  28.14 
 
 
286 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  28.14 
 
 
286 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  27.87 
 
 
279 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  27.87 
 
 
279 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  34.34 
 
 
283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  28.14 
 
 
286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  35.94 
 
 
282 aa  119  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  31.94 
 
 
282 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  29.86 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  29.86 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  27.8 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  28.62 
 
 
281 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  31.51 
 
 
284 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2216  degV family protein  41.63 
 
 
282 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202222  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  28.14 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  31.71 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  31.52 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12445  hypothetical protein  37.54 
 
 
280 aa  112  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  29.9 
 
 
287 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  28.88 
 
 
282 aa  112  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  30.18 
 
 
279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  29.12 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  31.82 
 
 
292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  32.51 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3640  degV family protein  29.86 
 
 
284 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00084182  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  29.18 
 
 
282 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3922  degV family protein  33.88 
 
 
277 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  30.18 
 
 
279 aa  109  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  29.17 
 
 
287 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1342  DegV family protein  27.92 
 
 
282 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  27.24 
 
 
293 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0150  degV family protein  31.46 
 
 
833 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  28.36 
 
 
288 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1009  hypothetical protein  28.85 
 
 
295 aa  107  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000831785  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0773  degV family protein  28.36 
 
 
288 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  31.74 
 
 
285 aa  106  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1102  degV family protein  32.88 
 
 
285 aa  106  5e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2657  degV family protein  33.88 
 
 
282 aa  106  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.108706  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  26.99 
 
 
284 aa  106  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13260  degV family protein  41.64 
 
 
298 aa  105  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  30.28 
 
 
279 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0502  DegV family protein  27.05 
 
 
278 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3190  degV family protein  31.85 
 
 
286 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  34.08 
 
 
282 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  30.39 
 
 
281 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  28.37 
 
 
290 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  30.17 
 
 
280 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  25.68 
 
 
281 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>