240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1102 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1102  degV family protein  100 
 
 		 285 aa  583  1.0000000000000001e-165  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1941  degV family protein  36.62 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.676322  normal  0.0830662 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  35.46 
 
 		 281 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  34.75 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  32.76 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  32.62 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  36.24 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1346  degV family protein  31.45 
 
 		 285 aa  149  6e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000423289  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  31.47 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  31.58 
 
 		 285 aa  142  6e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  34.04 
 
 		 280 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  31.45 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  33.1 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  33.33 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  33.33 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  33.1 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  33.33 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  33.1 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  32.37 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  31.18 
 
 		 287 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  32.63 
 
 		 280 aa  125  9e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  33.22 
 
 		 285 aa  125  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  30.58 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  30.94 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  31.52 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  30.55 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  30.58 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  30.58 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  30.58 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  32.27 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  30.94 
 
 		 286 aa  122  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  33.1 
 
 		 282 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  33.1 
 
 		 282 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  30.22 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  30.22 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  32.86 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  32.63 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0362  degV family protein  30.24 
 
 		 288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  30.43 
 
 		 287 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  30 
 
 		 280 aa  119  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  28.14 
 
 		 289 aa  119  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  30.58 
 
 		 286 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  30.96 
 
 		 286 aa  116  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  30.58 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  29.93 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  29.79 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  27.74 
 
 		 299 aa  113  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0615  DegV family protein  31.67 
 
 		 282 aa  112  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  35.41 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  30.18 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  31.47 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2246  degV family protein  30.28 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  29.07 
 
 		 280 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  29.02 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  28.08 
 
 		 637 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  32.86 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  29.29 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  30.39 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  29.64 
 
 		 281 aa  106  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  29.76 
 
 		 288 aa  106  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  30.39 
 
 		 282 aa  105  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  29.41 
 
 		 288 aa  105  9e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1521  hypothetical protein  28.87 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  27.97 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  29.54 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  29.89 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1522  hypothetical protein  32.09 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.487789  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0442  DegV family protein  31.33 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.416835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  30.9 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  28.42 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  29.58 
 
 		 282 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  29.82 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  29.82 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  28.52 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  26.98 
 
 		 283 aa  99.8  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  27.27 
 
 		 292 aa  99  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28270  degV family protein  31.07 
 
 		 279 aa  99  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  31.75 
 
 		 281 aa  99  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06330  degV family protein  28.37 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.139961 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3161  degV family protein  30.42 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1983  degV family protein  32.88 
 
 		 331 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179481 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0022  degV family protein  26.3 
 
 		 288 aa  97.4  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.314645  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  31.33 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  28.57 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1009  hypothetical protein  32.71 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000831785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  30.47 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  30.33 
 
 		 281 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0600  degV family protein  27.68 
 
 		 683 aa  95.9  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100467 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  28.21 
 
 		 279 aa  95.9  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  27.76 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0416  DegV family protein  25.19 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  27.01 
 
 		 288 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1644  degV family protein  26.57 
 
 		 604 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.524877  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  30.4 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  27.97 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0773  degV family protein  27.01 
 
 		 288 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  28.52 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  28.17 
 
 		 326 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  28.52 
 
 		 280 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  32.63 
 
 		 280 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>