236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1009 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1009  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  603  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000831785  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  43.84 
 
 
292 aa  238  1e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  37.68 
 
 
281 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  38.38 
 
 
281 aa  205  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  38.03 
 
 
280 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  37.1 
 
 
280 aa  202  7e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  37.1 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  37.1 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  36.75 
 
 
280 aa  198  9e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  36.75 
 
 
280 aa  198  9e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  36.4 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  36.4 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  36.4 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  36.4 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  36.04 
 
 
280 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1018  hypothetical protein  32.87 
 
 
313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0136614  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1342  DegV family protein  33.45 
 
 
282 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  34.4 
 
 
284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  31.27 
 
 
288 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0773  degV family protein  31.27 
 
 
288 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0416  DegV family protein  30.66 
 
 
288 aa  145  6e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1521  hypothetical protein  31.47 
 
 
293 aa  143  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  31.23 
 
 
280 aa  143  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  31.58 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  31.23 
 
 
280 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  31.23 
 
 
280 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  31.23 
 
 
287 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  31.23 
 
 
287 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  31.23 
 
 
287 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  30.88 
 
 
280 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  31.01 
 
 
282 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  31.01 
 
 
282 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  30.18 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1656  hypothetical protein  30.36 
 
 
281 aa  133  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  33.8 
 
 
282 aa  132  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  30.21 
 
 
283 aa  132  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  30.6 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0126  hypothetical protein  29.77 
 
 
293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000467213  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  30.6 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  30.28 
 
 
279 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  29.58 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  33.62 
 
 
312 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  32.89 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  32.64 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  33.33 
 
 
282 aa  127  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  31.4 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  28.57 
 
 
281 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1522  hypothetical protein  28.09 
 
 
295 aa  124  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.487789  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  28.27 
 
 
282 aa  123  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  29.12 
 
 
282 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1014  hypothetical protein  27.36 
 
 
282 aa  122  7e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  38.68 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  29.07 
 
 
281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  30.66 
 
 
279 aa  120  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  31.25 
 
 
279 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  30.21 
 
 
280 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  30 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  27.18 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  30.72 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  27.42 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  29.27 
 
 
282 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  28.37 
 
 
281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  25.78 
 
 
281 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  28.37 
 
 
282 aa  115  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  29.43 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  33.92 
 
 
286 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  33.92 
 
 
286 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  33.92 
 
 
286 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  33.92 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  32.39 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0772  degV family protein  30.8 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  30 
 
 
284 aa  113  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  33.92 
 
 
286 aa  113  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  33.92 
 
 
286 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  34.36 
 
 
286 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  33.92 
 
 
286 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  26.86 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  29.02 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  33.48 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1185  hypothetical protein  27.21 
 
 
277 aa  110  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  27.17 
 
 
284 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  28.92 
 
 
279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0502  DegV family protein  30.6 
 
 
278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  32.02 
 
 
287 aa  109  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  27.92 
 
 
279 aa  109  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1346  degV family protein  30.67 
 
 
285 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000423289  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2246  degV family protein  29.02 
 
 
297 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1941  degV family protein  25.53 
 
 
284 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.676322  normal  0.0830662 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  28.67 
 
 
280 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0758  hypothetical protein  27.68 
 
 
284 aa  107  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.642534  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  28.32 
 
 
279 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  27.97 
 
 
279 aa  106  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  29.24 
 
 
285 aa  106  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  27.92 
 
 
279 aa  104  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  27.84 
 
 
283 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  28.77 
 
 
280 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  26.9 
 
 
281 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  27.05 
 
 
285 aa  103  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  27.21 
 
 
279 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  26.19 
 
 
303 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>