234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0416 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0416  DegV family protein  100 
 
 		 288 aa  596  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  66.44 
 
 		 288 aa  381  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0773  degV family protein  66.44 
 
 		 288 aa  381  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  41.99 
 
 		 281 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  40.93 
 
 		 281 aa  234  9e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  41.81 
 
 		 280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  43.21 
 
 		 280 aa  230  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  42.16 
 
 		 280 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  42.16 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  42.16 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  42.16 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  42.16 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  42.16 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  42.16 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  42.16 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  42.16 
 
 		 280 aa  222  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  39.08 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  35.23 
 
 		 284 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  35.71 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0126  hypothetical protein  34.52 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000467213  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1522  hypothetical protein  31.8 
 
 		 295 aa  162  7e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.487789  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1018  hypothetical protein  32.51 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0136614  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1342  DegV family protein  32.53 
 
 		 282 aa  159  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1009  hypothetical protein  30.88 
 
 		 295 aa  155  9e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000831785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  32.5 
 
 		 280 aa  152  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  33.45 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  33.45 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1521  hypothetical protein  29.72 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  31.8 
 
 		 285 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0362  degV family protein  31.49 
 
 		 288 aa  145  8.000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  32.04 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  32.04 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  32.04 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  32.39 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  32.04 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  31.69 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  31.07 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  32.49 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  35.65 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  31.65 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  32.27 
 
 		 283 aa  142  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  31.82 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  31.82 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  30.77 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1656  hypothetical protein  33.1 
 
 		 281 aa  139  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  31.21 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  32.86 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  32.04 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0022  degV family protein  29.72 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.314645  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  30.14 
 
 		 286 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  31.77 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  28.78 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  29.64 
 
 		 279 aa  132  9e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  29.03 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  29.18 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  29.93 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0620  DegV family protein  27.7 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  31.91 
 
 		 287 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  32.75 
 
 		 285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  29.58 
 
 		 288 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  29.12 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0442  DegV family protein  31.32 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.416835  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  30.71 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  31.9 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  30.58 
 
 		 279 aa  125  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  30.58 
 
 		 279 aa  125  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  30.47 
 
 		 282 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  29.02 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1014  hypothetical protein  29.86 
 
 		 282 aa  123  4e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0910  hypothetical protein  30.99 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104198 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  28.97 
 
 		 292 aa  122  8e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  29.02 
 
 		 283 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  25.87 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06330  degV family protein  29.35 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.139961 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  30.36 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  28.47 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  29.18 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  28.11 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  28.83 
 
 		 282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0772  degV family protein  29.64 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  28.37 
 
 		 281 aa  119  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  29.29 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  28.47 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  28.33 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  29.64 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  27.05 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  28.77 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  30.04 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  29.39 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  28.37 
 
 		 282 aa  115  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  27.6 
 
 		 280 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  27.66 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  27.93 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0602  degV family protein  27.76 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  29.97 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  30.11 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  30.11 
 
 		 282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  28.17 
 
 		 293 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  28.57 
 
 		 281 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  27.49 
 
 		 285 aa  112  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>