226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06330 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_06330  degV family protein  100 
 
 
293 aa  600  1.0000000000000001e-171  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.139961 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  57.68 
 
 
291 aa  360  1e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  54.79 
 
 
292 aa  338  5e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  36.52 
 
 
287 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  36.43 
 
 
291 aa  199  6e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  37.5 
 
 
286 aa  192  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  36.46 
 
 
286 aa  185  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  36.46 
 
 
286 aa  185  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  36.81 
 
 
286 aa  185  9e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  36.46 
 
 
286 aa  185  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  36.46 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  36.46 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  36.46 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  36.77 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  36.81 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  36.81 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  36.46 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  34.81 
 
 
289 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  37.15 
 
 
287 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1558  DegV family protein  34.39 
 
 
295 aa  176  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  33.45 
 
 
292 aa  176  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  38.68 
 
 
293 aa  175  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  35.99 
 
 
281 aa  169  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  37.5 
 
 
287 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  34.71 
 
 
281 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0606  DegV family protein  31.85 
 
 
295 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  32.53 
 
 
286 aa  155  6e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  33.78 
 
 
286 aa  154  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  33.11 
 
 
285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1056  degV family protein  30.14 
 
 
297 aa  143  4e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  31.8 
 
 
282 aa  139  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1061  degV family protein  30.58 
 
 
294 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0946944  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1121  degV family protein  28.67 
 
 
294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  31.03 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16140  hypothetical protein  29.76 
 
 
308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000224707 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09150  hypothetical protein  29.66 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000277277  normal  0.476622 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  32.16 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  30.58 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1150  degV family protein  31.72 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.444716  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  29.27 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  29.45 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  30.42 
 
 
282 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09160  degV family protein  30.58 
 
 
311 aa  123  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.356982  normal  0.378413 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  31.96 
 
 
290 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  29.51 
 
 
280 aa  122  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  30.2 
 
 
281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  29.17 
 
 
284 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  25.34 
 
 
303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  27.3 
 
 
285 aa  113  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1032  degV family protein  29.05 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.185654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  30.95 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0416  DegV family protein  29.01 
 
 
288 aa  112  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  29.47 
 
 
285 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  32.87 
 
 
281 aa  112  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  27.49 
 
 
280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  27.15 
 
 
280 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  27.15 
 
 
280 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  27.15 
 
 
287 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0773  degV family protein  29.54 
 
 
288 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  27.15 
 
 
287 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  29.54 
 
 
288 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  26.74 
 
 
287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  31.21 
 
 
299 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  29.79 
 
 
279 aa  109  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  26.74 
 
 
280 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  28.32 
 
 
281 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  27.37 
 
 
279 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  27.37 
 
 
279 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  28.91 
 
 
312 aa  106  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1342  DegV family protein  28.47 
 
 
282 aa  105  8e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  26.96 
 
 
282 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  26.96 
 
 
282 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  30.18 
 
 
279 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  29.01 
 
 
283 aa  105  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1644  degV family protein  31.36 
 
 
604 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.524877  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  28.01 
 
 
281 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1018  hypothetical protein  28.81 
 
 
313 aa  105  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0136614  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  26.48 
 
 
292 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  28.09 
 
 
292 aa  104  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  29.45 
 
 
279 aa  103  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0442  DegV family protein  29.12 
 
 
291 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.416835  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0910  hypothetical protein  29.47 
 
 
285 aa  103  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104198 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  28.32 
 
 
284 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  27.3 
 
 
281 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  29.82 
 
 
279 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0600  degV family protein  28.42 
 
 
683 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100467 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  29.76 
 
 
271 aa  102  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1941  degV family protein  26.74 
 
 
284 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.676322  normal  0.0830662 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  28.67 
 
 
280 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0982  degV family protein  25.52 
 
 
342 aa  100  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  32.53 
 
 
296 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  29.51 
 
 
283 aa  99.8  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  28.24 
 
 
281 aa  99.4  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_903  DegV  28.67 
 
 
285 aa  99.4  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00149031  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  29.35 
 
 
280 aa  99  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  30.77 
 
 
287 aa  99  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1102  degV family protein  28.37 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  28.81 
 
 
280 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  26.37 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  27.34 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>