235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3519 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  100 
 
 		 281 aa  553  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0602  degV family protein  91.76 
 
 		 281 aa  485  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  46.52 
 
 		 277 aa  232  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  33.33 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  34.18 
 
 		 281 aa  175  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  36.43 
 
 		 280 aa  169  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  32.97 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  32.97 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  32.97 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  37.05 
 
 		 282 aa  169  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  32.25 
 
 		 280 aa  169  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  32.25 
 
 		 280 aa  169  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  32.6 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  32.6 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  32.6 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  32.6 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  34.53 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  34.17 
 
 		 287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  32.6 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  31.5 
 
 		 280 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  35 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  35 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  35 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  35 
 
 		 287 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  36.26 
 
 		 279 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  35 
 
 		 287 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  35.53 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  36.26 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  34.43 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  33.93 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  34.07 
 
 		 279 aa  159  4e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  34.75 
 
 		 282 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  34.75 
 
 		 282 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  33.7 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  32.12 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  30.22 
 
 		 282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  29.39 
 
 		 282 aa  155  8e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  32.36 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  32.37 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  31.27 
 
 		 281 aa  152  8e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  31.67 
 
 		 282 aa  152  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  30.8 
 
 		 280 aa  149  6e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  34.05 
 
 		 280 aa  148  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  31.43 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  31.79 
 
 		 279 aa  146  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  31.07 
 
 		 279 aa  146  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  34.17 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  30.32 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  34.64 
 
 		 282 aa  143  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  30.29 
 
 		 282 aa  142  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  27.56 
 
 		 299 aa  142  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  30.36 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  36.14 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  36.14 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  31.64 
 
 		 281 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  30.07 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  29.71 
 
 		 281 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  36.79 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  29.24 
 
 		 282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  28.52 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  29.82 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  32.86 
 
 		 284 aa  132  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  31.02 
 
 		 285 aa  132  7.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  29.04 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  34.18 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0910  hypothetical protein  38.83 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104198 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  29.14 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  31.16 
 
 		 279 aa  129  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  29.78 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1014  hypothetical protein  29.18 
 
 		 282 aa  128  8.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  27.96 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  30.71 
 
 		 279 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  30.8 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  29.82 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  26.41 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  29.89 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  32.14 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  28.32 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0620  DegV family protein  32.26 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  29.29 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  36.88 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  27.76 
 
 		 283 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1185  hypothetical protein  28.57 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  27.62 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  27.97 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  27.97 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  28.01 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  28.57 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  30.47 
 
 		 279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  27.02 
 
 		 290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  27.37 
 
 		 286 aa  118  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  28.93 
 
 		 286 aa  118  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  29.02 
 
 		 312 aa  118  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  34.86 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  26.74 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1342  DegV family protein  27.34 
 
 		 282 aa  117  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  27.08 
 
 		 281 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1346  degV family protein  27.68 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000423289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  29.47 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  28.21 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>