230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5472 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  100 
 
 
326 aa  648    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3849  degV family protein  57.3 
 
 
286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3470  degV family protein  57.65 
 
 
286 aa  252  5.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.748591  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  51.25 
 
 
284 aa  225  8e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  52.17 
 
 
296 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  47.18 
 
 
284 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  51.61 
 
 
280 aa  223  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  45.58 
 
 
283 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2272  hypothetical protein  48.55 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6798  degV family protein  46.84 
 
 
283 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2246  degV family protein  44.11 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28270  degV family protein  41.79 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1983  degV family protein  42.76 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6052  degV family protein  42.39 
 
 
280 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  33.69 
 
 
284 aa  155  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3190  degV family protein  37.94 
 
 
286 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  34.53 
 
 
279 aa  151  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  31.21 
 
 
281 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  39.93 
 
 
285 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  35.74 
 
 
279 aa  149  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  32.86 
 
 
280 aa  149  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  32.61 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  32.61 
 
 
279 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  38.33 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  34.53 
 
 
279 aa  146  6e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3526  degV family protein  36.79 
 
 
278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3599  degV family protein  36.79 
 
 
278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  32.17 
 
 
279 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3531  degV family protein  36.79 
 
 
278 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.766898 
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  31.16 
 
 
279 aa  142  6e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  31.47 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  33.1 
 
 
282 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  31.77 
 
 
282 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  36.46 
 
 
286 aa  139  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  32.01 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  32.01 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  31.21 
 
 
281 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  32.01 
 
 
280 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  32.01 
 
 
280 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  31.65 
 
 
280 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  32.01 
 
 
280 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  32.01 
 
 
280 aa  136  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  32.01 
 
 
280 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  31.65 
 
 
280 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  31.65 
 
 
280 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  37.55 
 
 
287 aa  135  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  35.59 
 
 
277 aa  135  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  29.29 
 
 
281 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  32.01 
 
 
280 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3922  degV family protein  36.3 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12470  degV family protein  38.35 
 
 
324 aa  134  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.403372  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  32.64 
 
 
283 aa  132  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  34.17 
 
 
279 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  29.29 
 
 
287 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  32.16 
 
 
282 aa  129  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  34.15 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  30.77 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  29.47 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2657  degV family protein  35.56 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.108706  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17350  degV family protein  36.94 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173682  hitchhiker  0.00667437 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  31.29 
 
 
286 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  30.77 
 
 
283 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2804  degV family protein  36.88 
 
 
279 aa  127  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  30.15 
 
 
279 aa  125  7e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  29.18 
 
 
284 aa  125  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  30.27 
 
 
281 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  30.63 
 
 
293 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  29.14 
 
 
287 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  31.52 
 
 
280 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  29.41 
 
 
279 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12445  hypothetical protein  38.71 
 
 
280 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  28.47 
 
 
280 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  34.4 
 
 
280 aa  124  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  32.49 
 
 
637 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  30.25 
 
 
292 aa  122  9e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  27.44 
 
 
282 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  32.17 
 
 
286 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  34.64 
 
 
271 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0773  degV family protein  32.6 
 
 
288 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  32.6 
 
 
288 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  27.8 
 
 
281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  32.18 
 
 
282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  31.29 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1009  hypothetical protein  27.42 
 
 
295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000831785  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  30.8 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  29.41 
 
 
279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  31.29 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  31.29 
 
 
280 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  28.78 
 
 
279 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  31.29 
 
 
280 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  31.29 
 
 
280 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  28.78 
 
 
279 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  27.27 
 
 
299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  30.8 
 
 
280 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  27.8 
 
 
280 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  32.17 
 
 
286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  27.72 
 
 
285 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  31.71 
 
 
286 aa  119  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  31.82 
 
 
286 aa  119  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  31.43 
 
 
282 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>