239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0172 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  100 
 
 		 279 aa  565  1e-160  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  78.85 
 
 		 279 aa  462  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  48.74 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  37.91 
 
 		 279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  36.97 
 
 		 280 aa  183  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  35.16 
 
 		 282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  35.59 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  35.29 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  35.14 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  34.78 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  34.78 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  35.27 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  35.64 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  35.94 
 
 		 287 aa  152  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  35.02 
 
 		 282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2384  degV family protein  34.53 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  35.74 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  33.92 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  32.16 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  33.21 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  35.16 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  37.54 
 
 		 282 aa  149  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  34.42 
 
 		 280 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  36 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  35.77 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  34.04 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  36 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  35.38 
 
 		 271 aa  145  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  34.32 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  35.27 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  34.89 
 
 		 296 aa  143  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  33.7 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  33.33 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  32.97 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  32.97 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  32.97 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  32.97 
 
 		 287 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  32.97 
 
 		 287 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  32.97 
 
 		 280 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  31.32 
 
 		 281 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  33.21 
 
 		 282 aa  142  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  31.65 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  32.73 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  32.73 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  32.61 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0171  DegV family protein  32.38 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  34.4 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  34.4 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  33.78 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  34.53 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  32.04 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  32.25 
 
 		 280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  33.33 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  34.88 
 
 		 282 aa  132  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  31.41 
 
 		 279 aa  132  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  31.05 
 
 		 279 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  32.1 
 
 		 290 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  28.72 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  30.43 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  30.36 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  30.36 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  36.11 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  30 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  30 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  27.4 
 
 		 282 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  32.14 
 
 		 279 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  32.14 
 
 		 279 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3849  degV family protein  36.28 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  30 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  30 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  30 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  32.04 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0150  degV family protein  35.09 
 
 		 833 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  30.71 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  30 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  32.03 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  29.64 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0022  degV family protein  34.14 
 
 		 288 aa  125  6e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.314645  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  29.52 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3470  degV family protein  38.74 
 
 		 286 aa  125  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.748591  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  29.29 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  32.16 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  29.72 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0602  degV family protein  31.07 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  30.47 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  31.65 
 
 		 284 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  30.82 
 
 		 281 aa  122  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1102  degV family protein  30.04 
 
 		 285 aa  122  8e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6798  degV family protein  35.25 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  33.68 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  30 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  28.52 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  30.39 
 
 		 281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  31.77 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  31.79 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0362  degV family protein  32.51 
 
 		 288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1346  degV family protein  29.82 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000423289  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  29.33 
 
 		 291 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  31.41 
 
 		 283 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  31.96 
 
 		 311 aa  119  7e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>