242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1500 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  577  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  49.29 
 
 		 282 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  49.64 
 
 		 293 aa  265  7e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  44.24 
 
 		 284 aa  248  6e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  39.57 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  38.85 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  39.01 
 
 		 285 aa  203  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1941  degV family protein  34.18 
 
 		 284 aa  195  9e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.676322  normal  0.0830662 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  36.69 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  35.38 
 
 		 279 aa  186  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  33.21 
 
 		 303 aa  165  8e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  33.33 
 
 		 280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  32.26 
 
 		 280 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1102  degV family protein  32.62 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  32.73 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  32.26 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  31.9 
 
 		 280 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  31.9 
 
 		 280 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  31.9 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  31.9 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  31.9 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  28.42 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  30.94 
 
 		 282 aa  149  6e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  29.54 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  28.83 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  31.67 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  31.67 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  30.82 
 
 		 280 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  31.77 
 
 		 281 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  30.43 
 
 		 280 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  29.54 
 
 		 281 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  32.74 
 
 		 286 aa  142  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  30.6 
 
 		 286 aa  142  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  32.38 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  32.03 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  32.03 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  32.03 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  31.67 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  31.67 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  32.38 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  31.67 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  32.03 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  32.38 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  32.03 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  30.56 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0600  degV family protein  28.06 
 
 		 683 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  31.29 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  27.14 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  31.07 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  30.15 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  30.88 
 
 		 291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  32.13 
 
 		 284 aa  135  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2272  hypothetical protein  29.64 
 
 		 282 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  31.65 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  29.71 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  29.71 
 
 		 296 aa  132  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  30.6 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  29.18 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  28.72 
 
 		 637 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  29.08 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  31.23 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  29.39 
 
 		 287 aa  129  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  26.88 
 
 		 280 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  30.11 
 
 		 281 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1346  degV family protein  29.23 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000423289  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  28.42 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  28.98 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06330  degV family protein  29.27 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.139961 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  25.45 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  28.17 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  28.37 
 
 		 292 aa  126  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1342  DegV family protein  26.2 
 
 		 282 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  29.54 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  29.54 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  28.32 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  27.24 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  27.96 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  27.34 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1080  hypothetical protein  33.48 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.670701  normal  0.358327 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  27.24 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  25.98 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  26.22 
 
 		 280 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  26.22 
 
 		 280 aa  122  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  26.22 
 
 		 280 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  27.6 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  25.87 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  25.96 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  28.67 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  25.87 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  25.96 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1014  hypothetical protein  29.89 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1018  hypothetical protein  28.01 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0136614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  28.67 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  26.95 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  28.93 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  30.82 
 
 		 279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  26.22 
 
 		 280 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0288  DegV family protein  32.62 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0442  DegV family protein  31.43 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.416835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  26.22 
 
 		 280 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>