220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1080 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1080  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  585  1e-166  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.670701  normal  0.358327 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  30.91 
 
 		 279 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  33.57 
 
 		 282 aa  149  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  33.48 
 
 		 281 aa  123  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  31.58 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  29.64 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  28.99 
 
 		 279 aa  116  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  28.99 
 
 		 279 aa  115  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  29.71 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  31.37 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  28.35 
 
 		 283 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  29.35 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  28.99 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  28.57 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  28.32 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  28.62 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  28.67 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  22.11 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  28.62 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  28.99 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  29.2 
 
 		 280 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  29.2 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  29.2 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  28.99 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  28.24 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  26.26 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  29.24 
 
 		 282 aa  106  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  28.83 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1522  hypothetical protein  28.41 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.487789  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  29.34 
 
 		 282 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  29.34 
 
 		 282 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  27.55 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  27.55 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  25.39 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  25.82 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  28.93 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  27.9 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  25.82 
 
 		 281 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  31.4 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  27.6 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1941  degV family protein  29.77 
 
 		 284 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.676322  normal  0.0830662 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  26.85 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  26.3 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  25.45 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  27.76 
 
 		 281 aa  99.4  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  29.43 
 
 		 281 aa  99.4  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  27.4 
 
 		 281 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  26.99 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  24.61 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  25.09 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  24.61 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  26.16 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  26.16 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  24.22 
 
 		 280 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  24.22 
 
 		 280 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  30.94 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  24.22 
 
 		 280 aa  95.9  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  24.22 
 
 		 280 aa  95.9  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  24.22 
 
 		 280 aa  95.9  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  29.29 
 
 		 271 aa  95.5  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  27.99 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  24.82 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  25.71 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  31.84 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0126  hypothetical protein  27.53 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000467213  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  25.82 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  25.82 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  23.83 
 
 		 280 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0620  DegV family protein  26.64 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  27.92 
 
 		 281 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09170  degV family protein  32.44 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.266589 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  24.22 
 
 		 280 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  23.83 
 
 		 280 aa  92.8  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  25.52 
 
 		 282 aa  92.4  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0982  degV family protein  29.66 
 
 		 342 aa  92  9e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  24.15 
 
 		 285 aa  92  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1032  degV family protein  27.96 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.185654  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  30.36 
 
 		 281 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  25.66 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0773  degV family protein  27.45 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  27.45 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0602  degV family protein  29.47 
 
 		 281 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0772  degV family protein  26.09 
 
 		 280 aa  90.1  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0416  DegV family protein  25.88 
 
 		 288 aa  89.4  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  28.32 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  28.57 
 
 		 285 aa  89  9e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0150  degV family protein  29.17 
 
 		 833 aa  88.2  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  24.45 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  23.72 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  27.44 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  21.9 
 
 		 282 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  25.82 
 
 		 281 aa  87.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1102  degV family protein  27.24 
 
 		 285 aa  86.3  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  27.05 
 
 		 286 aa  85.9  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  30.07 
 
 		 286 aa  85.9  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16140  hypothetical protein  27.56 
 
 		 308 aa  85.9  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224707 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  23.66 
 
 		 293 aa  85.5  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  24.41 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  27.34 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  23.95 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>