212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16140 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_16140  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  637    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224707 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1150  degV family protein  62.54 
 
 		 309 aa  406  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.444716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09160  degV family protein  58.12 
 
 		 311 aa  354  1e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.356982  normal  0.378413 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09150  hypothetical protein  50.81 
 
 		 309 aa  318  1e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000277277  normal  0.476622 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0982  degV family protein  42.07 
 
 		 342 aa  245  6e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1121  degV family protein  31.27 
 
 		 294 aa  168  8e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  32.06 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  32.75 
 
 		 293 aa  162  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  33.33 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  31.36 
 
 		 291 aa  155  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  32.51 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  29.76 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  31.21 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  29.68 
 
 		 289 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  29.69 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06330  degV family protein  29.76 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.139961 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1558  DegV family protein  27.3 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  30.27 
 
 		 289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  28.92 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  29.54 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  28.52 
 
 		 286 aa  135  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  28.57 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  28.93 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1056  degV family protein  26.22 
 
 		 297 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  31.72 
 
 		 290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0606  DegV family protein  27.46 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  28.32 
 
 		 281 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  27.37 
 
 		 286 aa  125  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  25.44 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  29.35 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  27.02 
 
 		 286 aa  122  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  26.67 
 
 		 286 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  26.67 
 
 		 286 aa  122  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1061  degV family protein  23.96 
 
 		 294 aa  122  9e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0946944  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  26.67 
 
 		 286 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  26.67 
 
 		 286 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  26.67 
 
 		 286 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  27.02 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  26.67 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  26.67 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  29.23 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  26.22 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  28.11 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  28.77 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  30.2 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  27.12 
 
 		 312 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  27.87 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  23.76 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  30.28 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  24.91 
 
 		 281 aa  106  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  23.91 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  23.91 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  23.91 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  23.91 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  23.91 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  23.91 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  23.91 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  23.91 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  27.82 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  28.32 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  29.29 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  23.55 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  23.55 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  26.48 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  28.04 
 
 		 299 aa  99.8  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  26.46 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  26.3 
 
 		 283 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  30.17 
 
 		 283 aa  98.6  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16150  hypothetical protein  26.26 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239728 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  24.91 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  24.91 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  25.95 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  29.14 
 
 		 279 aa  96.3  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  26.39 
 
 		 281 aa  96.3  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  27.97 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  26.12 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  24.73 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1522  hypothetical protein  24.59 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.487789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  24.65 
 
 		 282 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  27.9 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  28.69 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1941  degV family protein  24.48 
 
 		 284 aa  90.5  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.676322  normal  0.0830662 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  26.15 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  25.8 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  23.86 
 
 		 284 aa  89.7  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  26.71 
 
 		 279 aa  89.7  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1009  hypothetical protein  27.27 
 
 		 295 aa  89  9e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000831785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  22.89 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  25.09 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  27.62 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  25.52 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1080  hypothetical protein  25.28 
 
 		 293 aa  87  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.670701  normal  0.358327 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0416  DegV family protein  23.64 
 
 		 288 aa  87  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1346  degV family protein  22.22 
 
 		 285 aa  86.7  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000423289  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  28.72 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  24.66 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  21.66 
 
 		 282 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  24.01 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  25.61 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  23.88 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>