237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17990 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  100 
 
 
285 aa  583  1e-166  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  37.86 
 
 
279 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  36.33 
 
 
279 aa  163  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  36.3 
 
 
280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  34.15 
 
 
280 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  33.93 
 
 
279 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  34.4 
 
 
279 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  34.04 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  36.23 
 
 
282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  36.76 
 
 
277 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  35.36 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  34.53 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  33.1 
 
 
290 aa  145  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  34.29 
 
 
279 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  32.99 
 
 
287 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  31.88 
 
 
280 aa  143  4e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  31.77 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  31.85 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  30.58 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  33.22 
 
 
279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  33.22 
 
 
279 aa  138  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  33.1 
 
 
287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  31.41 
 
 
280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  33.33 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  33.18 
 
 
279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0602  degV family protein  30.29 
 
 
281 aa  132  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129172  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  31.1 
 
 
285 aa  132  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  31.51 
 
 
291 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  31.73 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  30.8 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  28.47 
 
 
281 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  33.33 
 
 
282 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  31.62 
 
 
279 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  31.02 
 
 
281 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  27.56 
 
 
281 aa  128  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  33.48 
 
 
291 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  31.67 
 
 
299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  30.48 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  32.28 
 
 
286 aa  125  9e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  32.68 
 
 
279 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  28.77 
 
 
282 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  31.34 
 
 
281 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  29.37 
 
 
293 aa  122  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  28.27 
 
 
283 aa  122  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  30.14 
 
 
286 aa  122  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  27.24 
 
 
276 aa  122  9e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0022  degV family protein  30 
 
 
288 aa  122  9e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.314645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  30.77 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  28.22 
 
 
280 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  29.51 
 
 
286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  31.1 
 
 
281 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  28.72 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  27.86 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  30.36 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  27.46 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1216  DegV family protein  27.76 
 
 
278 aa  116  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  28.37 
 
 
286 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  28.37 
 
 
286 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  28.37 
 
 
286 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  28.37 
 
 
286 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  29.72 
 
 
282 aa  115  8.999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1032  degV family protein  29.31 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.185654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  28.37 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  28.98 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  28.72 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  28.87 
 
 
281 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  27.68 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  28.47 
 
 
281 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  27.68 
 
 
286 aa  112  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1521  hypothetical protein  29.14 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  34.38 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  25.44 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  28.27 
 
 
289 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0600  degV family protein  29.03 
 
 
683 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100467 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  25.74 
 
 
279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  25.74 
 
 
279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  28.52 
 
 
292 aa  109  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0362  degV family protein  29.68 
 
 
288 aa  108  8.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0442  DegV family protein  31.58 
 
 
291 aa  108  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.416835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  30.07 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  27.08 
 
 
637 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1342  DegV family protein  27.08 
 
 
282 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  25.09 
 
 
311 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  27.82 
 
 
281 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0126  hypothetical protein  29.62 
 
 
293 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000467213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  28.37 
 
 
280 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  28.37 
 
 
280 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  28.37 
 
 
287 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  28.37 
 
 
287 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  28.01 
 
 
287 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  30.82 
 
 
284 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  28.37 
 
 
280 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  26.74 
 
 
281 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  36.1 
 
 
287 aa  106  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1009  hypothetical protein  29.24 
 
 
295 aa  106  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000831785  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  28.01 
 
 
280 aa  106  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1522  hypothetical protein  27.66 
 
 
295 aa  106  6e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.487789  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_903  DegV  28.23 
 
 
285 aa  105  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00149031  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  24.73 
 
 
311 aa  105  9e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  28.77 
 
 
282 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>