245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2258 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  100 
 
 
293 aa  603  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  51.41 
 
 
287 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  50.35 
 
 
286 aa  298  5e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  50.7 
 
 
287 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  50.18 
 
 
286 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  49.65 
 
 
286 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  48.94 
 
 
286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  48.94 
 
 
286 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  49.29 
 
 
286 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  48.94 
 
 
286 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  48.94 
 
 
286 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  48.94 
 
 
286 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  49.29 
 
 
286 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  48.58 
 
 
286 aa  280  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  41.22 
 
 
281 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  41.43 
 
 
285 aa  232  5e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  40.7 
 
 
291 aa  218  6e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  40.35 
 
 
291 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  38.41 
 
 
287 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  37.99 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  37.54 
 
 
292 aa  198  9e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  39.72 
 
 
291 aa  196  3e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  40.21 
 
 
281 aa  192  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  35.25 
 
 
280 aa  186  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  35.52 
 
 
286 aa  176  6e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06330  degV family protein  38.68 
 
 
293 aa  175  6e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.139961 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  32.51 
 
 
292 aa  166  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  32.62 
 
 
280 aa  165  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  37.5 
 
 
289 aa  165  9e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  32.86 
 
 
286 aa  161  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  35.92 
 
 
292 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  31.67 
 
 
279 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  32.12 
 
 
282 aa  156  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1056  degV family protein  33.92 
 
 
297 aa  154  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16140  hypothetical protein  32.75 
 
 
308 aa  150  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000224707 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  30.36 
 
 
287 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  30.36 
 
 
303 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  32.62 
 
 
311 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  30.18 
 
 
283 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  31.9 
 
 
310 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  31.65 
 
 
281 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  30.18 
 
 
283 aa  143  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  28.77 
 
 
299 aa  142  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  31.52 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  31.18 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  31.07 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  31.07 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  29.54 
 
 
283 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  32.62 
 
 
282 aa  140  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  29.14 
 
 
281 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  32.62 
 
 
282 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1150  degV family protein  34.12 
 
 
309 aa  139  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.444716  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  28.47 
 
 
283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  29.5 
 
 
280 aa  136  4e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  28.06 
 
 
281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0606  DegV family protein  30.39 
 
 
295 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  30.9 
 
 
289 aa  135  7.000000000000001e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  32.74 
 
 
288 aa  135  9e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  30.71 
 
 
279 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  27.92 
 
 
281 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  31.01 
 
 
312 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09150  hypothetical protein  29.19 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000277277  normal  0.476622 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09160  degV family protein  34.62 
 
 
311 aa  133  3e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.356982  normal  0.378413 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  29.75 
 
 
279 aa  134  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  31.05 
 
 
282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  30.58 
 
 
280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1558  DegV family protein  28.98 
 
 
295 aa  132  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1061  degV family protein  29.93 
 
 
294 aa  132  6e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0946944  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0982  degV family protein  29.72 
 
 
342 aa  132  6e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  28.57 
 
 
276 aa  132  9e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  31.07 
 
 
280 aa  132  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  30.5 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  30.5 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  30.71 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  28.52 
 
 
279 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  31.07 
 
 
280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  31.07 
 
 
280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  31.07 
 
 
280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  33.69 
 
 
288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  31.07 
 
 
280 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  28.27 
 
 
280 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  28.52 
 
 
279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  30.71 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  30.42 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  30.71 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  28.37 
 
 
279 aa  128  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  29.33 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  28.01 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  27.62 
 
 
282 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  27.66 
 
 
279 aa  125  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1121  degV family protein  27.11 
 
 
294 aa  124  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  26.33 
 
 
280 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  29.97 
 
 
279 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  29.97 
 
 
279 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0600  degV family protein  26.6 
 
 
683 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100467 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  26.35 
 
 
282 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  26.6 
 
 
285 aa  122  5e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  29.37 
 
 
285 aa  122  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  28.62 
 
 
293 aa  122  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  26.71 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>