227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1061 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1061  degV family protein  100 
 
 
294 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0946944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0606  DegV family protein  43.69 
 
 
295 aa  265  8e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1558  DegV family protein  41.16 
 
 
295 aa  249  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1121  degV family protein  38.14 
 
 
294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1056  degV family protein  39.38 
 
 
297 aa  232  5e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  38.23 
 
 
287 aa  192  8e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  32.76 
 
 
291 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  34.25 
 
 
292 aa  163  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  31.96 
 
 
292 aa  163  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  33.11 
 
 
291 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  29.79 
 
 
289 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0982  degV family protein  29.9 
 
 
342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  29.47 
 
 
291 aa  139  7.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06330  degV family protein  30.58 
 
 
293 aa  138  8.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.139961 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  32.87 
 
 
287 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09160  degV family protein  29.66 
 
 
311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.356982  normal  0.378413 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  32.41 
 
 
287 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  29.93 
 
 
293 aa  132  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  29.41 
 
 
286 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  28.98 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  32.94 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09150  hypothetical protein  27.02 
 
 
309 aa  123  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000277277  normal  0.476622 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  31.14 
 
 
286 aa  122  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  31.72 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  31.38 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1150  degV family protein  29.33 
 
 
309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.444716  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  31.03 
 
 
286 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  31.38 
 
 
286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16140  hypothetical protein  23.96 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000224707 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  31.32 
 
 
279 aa  119  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  31.03 
 
 
286 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  31.03 
 
 
286 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  31.03 
 
 
286 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  30.69 
 
 
286 aa  118  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  30.34 
 
 
286 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  27.08 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  26.74 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  26.86 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  31.03 
 
 
281 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  28.57 
 
 
280 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  27.93 
 
 
290 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  28.92 
 
 
281 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  27.05 
 
 
312 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  26.67 
 
 
283 aa  105  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  26.67 
 
 
287 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  29.72 
 
 
285 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  27.11 
 
 
279 aa  102  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  28.28 
 
 
282 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  28.42 
 
 
282 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  26.41 
 
 
279 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  28.42 
 
 
279 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  28.42 
 
 
279 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  26.06 
 
 
279 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  26.39 
 
 
287 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  30.2 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  26.39 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  26.39 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  26.39 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  26.39 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  25 
 
 
281 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  27.95 
 
 
285 aa  97.4  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  26.39 
 
 
280 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  25.43 
 
 
285 aa  96.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  26.14 
 
 
285 aa  96.7  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  25.69 
 
 
280 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  26.83 
 
 
284 aa  95.5  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  25.84 
 
 
280 aa  95.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  25.61 
 
 
282 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  25.61 
 
 
282 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  23.71 
 
 
281 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  23.26 
 
 
637 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  26.64 
 
 
283 aa  92.4  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  25.87 
 
 
280 aa  92  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3161  degV family protein  27.46 
 
 
283 aa  90.1  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1644  degV family protein  23.76 
 
 
604 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.524877  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  24.31 
 
 
281 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0028  hypothetical protein  25.68 
 
 
279 aa  89.4  7e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  24.74 
 
 
280 aa  89  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  25.61 
 
 
285 aa  89  9e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2384  degV family protein  26.16 
 
 
275 aa  88.2  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773987  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0602  degV family protein  23.02 
 
 
281 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129172  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  24.83 
 
 
280 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  25.55 
 
 
280 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  25.74 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  26.33 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  25.74 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  25.74 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  29.23 
 
 
283 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  25 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  25.86 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0951  degV family protein  22.7 
 
 
284 aa  87  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000125463 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  29.23 
 
 
283 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  26.48 
 
 
279 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  25.74 
 
 
280 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09170  degV family protein  25.94 
 
 
301 aa  87.4  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.266589 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  26.19 
 
 
293 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0620  DegV family protein  24.69 
 
 
281 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  25.74 
 
 
280 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  26.07 
 
 
277 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  25.74 
 
 
280 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>