232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3161 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3161  degV family protein  100 
 
 
283 aa  577  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  40.28 
 
 
282 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  30.77 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  31.23 
 
 
284 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  31.6 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  31.8 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  30.66 
 
 
299 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  31.34 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  37.62 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  31.56 
 
 
281 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  32.74 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  31.16 
 
 
285 aa  126  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  30.88 
 
 
293 aa  125  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  27.89 
 
 
287 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  31.27 
 
 
279 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  29.54 
 
 
281 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  31.91 
 
 
280 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  31.23 
 
 
282 aa  123  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  28.32 
 
 
287 aa  123  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  30.25 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  29.66 
 
 
287 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  31.58 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  30.69 
 
 
286 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  28.98 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  28.12 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  31.25 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  31.32 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  28.77 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  27.62 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  29.03 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  27.82 
 
 
287 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  27.82 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  27.82 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  28.17 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  27.5 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  27.82 
 
 
280 aa  112  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  27.82 
 
 
280 aa  112  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  29.76 
 
 
292 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  27.46 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  27.43 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  27.93 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  28.17 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  28.17 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  28.37 
 
 
281 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  27.82 
 
 
281 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  27.68 
 
 
282 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  26.79 
 
 
280 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  31.56 
 
 
284 aa  108  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  27.02 
 
 
281 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  26.15 
 
 
290 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  27.3 
 
 
282 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  27.62 
 
 
282 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  27.62 
 
 
282 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  30.1 
 
 
286 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  30.48 
 
 
286 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  29.68 
 
 
280 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1102  degV family protein  30.42 
 
 
285 aa  107  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  29.97 
 
 
286 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  29.76 
 
 
286 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  29.76 
 
 
286 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  29.76 
 
 
286 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  30.74 
 
 
280 aa  106  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  30 
 
 
286 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  27.72 
 
 
637 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  26.6 
 
 
326 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  28.23 
 
 
303 aa  105  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  26.83 
 
 
287 aa  105  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  30.39 
 
 
279 aa  104  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  27.34 
 
 
280 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  31.25 
 
 
277 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  29.76 
 
 
286 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  27.92 
 
 
280 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  27.92 
 
 
280 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  29.9 
 
 
279 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  30.34 
 
 
286 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  29.97 
 
 
286 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  24.74 
 
 
282 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1121  degV family protein  27.61 
 
 
294 aa  102  5e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  26.46 
 
 
289 aa  102  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  28.28 
 
 
291 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  24.82 
 
 
281 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  28.03 
 
 
286 aa  101  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  27.76 
 
 
280 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  27.76 
 
 
280 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  27.76 
 
 
280 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  27.76 
 
 
280 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  25.45 
 
 
281 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  25.36 
 
 
296 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  25.89 
 
 
276 aa  101  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  27.76 
 
 
280 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1009  hypothetical protein  30.73 
 
 
295 aa  101  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000831785  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  27.4 
 
 
280 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  29.59 
 
 
292 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  27.4 
 
 
280 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  29.64 
 
 
279 aa  99.8  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  26.9 
 
 
282 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  26.92 
 
 
291 aa  99.8  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  29.17 
 
 
279 aa  99  8e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  30.47 
 
 
279 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  28.23 
 
 
288 aa  98.2  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>