244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1265 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1265  degV family protein  100 
 
 
281 aa  569  1e-161  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  91.79 
 
 
280 aa  532  1e-150  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  92.14 
 
 
280 aa  532  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  52.71 
 
 
279 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  51.99 
 
 
279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  51.26 
 
 
279 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  50.18 
 
 
281 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  49.09 
 
 
281 aa  277  1e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  49.25 
 
 
276 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  45.59 
 
 
279 aa  246  4e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  44 
 
 
279 aa  244  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  46.32 
 
 
279 aa  243  3e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  45.59 
 
 
279 aa  243  3e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  44 
 
 
279 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  44 
 
 
279 aa  242  6e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  43.88 
 
 
282 aa  222  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  36.4 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  39.01 
 
 
279 aa  199  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  38.43 
 
 
277 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  35.87 
 
 
311 aa  188  7e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  35.87 
 
 
311 aa  186  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  35.74 
 
 
280 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  34.06 
 
 
310 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  39.86 
 
 
282 aa  179  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  31.64 
 
 
282 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  35.64 
 
 
280 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  33.21 
 
 
282 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  34.8 
 
 
282 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  33.45 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  32.75 
 
 
287 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  33.82 
 
 
280 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  33.82 
 
 
287 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  33.82 
 
 
280 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  33.82 
 
 
280 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  33.82 
 
 
287 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  32.75 
 
 
280 aa  159  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  33.7 
 
 
287 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  33.33 
 
 
280 aa  158  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  32.3 
 
 
299 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  32.97 
 
 
280 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  29.79 
 
 
290 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  35.16 
 
 
287 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  31.69 
 
 
287 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  33.57 
 
 
282 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  33.57 
 
 
282 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  30.94 
 
 
281 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  31.65 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  35.64 
 
 
279 aa  152  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  32.87 
 
 
283 aa  152  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  33.81 
 
 
285 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  31.8 
 
 
280 aa  149  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  28.88 
 
 
283 aa  149  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  32.59 
 
 
279 aa  149  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  32.61 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  33.33 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  31.45 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  32.1 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  31.45 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  35.04 
 
 
279 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  30.39 
 
 
280 aa  145  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  31.74 
 
 
286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  31.45 
 
 
280 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  31.45 
 
 
280 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  31.45 
 
 
280 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  31.27 
 
 
281 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  31.45 
 
 
280 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  31.45 
 
 
280 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  30.47 
 
 
283 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  31.45 
 
 
280 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  31.45 
 
 
280 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0602  degV family protein  31.02 
 
 
281 aa  142  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129172  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  30.11 
 
 
283 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  31.77 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  29.03 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  33.58 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3640  degV family protein  28 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00084182  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  32.13 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  28.47 
 
 
281 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  28.42 
 
 
291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  35.47 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  27.92 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  29.47 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3344  DegV family protein  26.74 
 
 
277 aa  132  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000036416  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  34.98 
 
 
279 aa  132  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  28.57 
 
 
286 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  29.64 
 
 
286 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0442  DegV family protein  30.25 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.416835  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1014  hypothetical protein  29.5 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  28.83 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  27.86 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0150  degV family protein  32.72 
 
 
833 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2272  hypothetical protein  32.14 
 
 
282 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  28.52 
 
 
286 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  27.86 
 
 
286 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  27.86 
 
 
286 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  27.86 
 
 
286 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  30.58 
 
 
288 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  31.27 
 
 
288 aa  130  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  27.86 
 
 
286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  28.21 
 
 
286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>