239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1049 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  100 
 
 
281 aa  583  1e-166  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  95.73 
 
 
281 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  92.75 
 
 
276 aa  536  1e-151  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  51.43 
 
 
279 aa  300  2e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  49.29 
 
 
279 aa  288  5.0000000000000004e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  48.21 
 
 
279 aa  279  3e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  50.18 
 
 
280 aa  278  8e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  49.09 
 
 
281 aa  277  1e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  49.82 
 
 
280 aa  275  4e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  41.79 
 
 
279 aa  219  3e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  42.18 
 
 
279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  40.36 
 
 
279 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  39.13 
 
 
279 aa  199  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  39.08 
 
 
279 aa  199  5e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  39.79 
 
 
279 aa  198  7e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  39.41 
 
 
277 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  31.05 
 
 
282 aa  175  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  34.62 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  35.02 
 
 
311 aa  170  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  35.02 
 
 
310 aa  170  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  37.55 
 
 
282 aa  163  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  34.93 
 
 
282 aa  161  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  36.33 
 
 
280 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  32.49 
 
 
311 aa  158  9e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  36.92 
 
 
282 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  30.36 
 
 
282 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  31.43 
 
 
282 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  31.56 
 
 
280 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  29.79 
 
 
281 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  32.75 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  33.92 
 
 
279 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  32.3 
 
 
299 aa  149  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  29.79 
 
 
281 aa  148  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  29.89 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  34.64 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  29.54 
 
 
281 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  29.58 
 
 
280 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  32.16 
 
 
279 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  28.52 
 
 
287 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  28.87 
 
 
280 aa  142  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  32.14 
 
 
280 aa  143  4e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  30.8 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  34.53 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  28.52 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  28.42 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  28.17 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  28.17 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  28.42 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  28.17 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  28.17 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  29.12 
 
 
280 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  28.93 
 
 
287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  31.12 
 
 
283 aa  139  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  31.82 
 
 
282 aa  138  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  27.86 
 
 
287 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  27.76 
 
 
280 aa  136  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  27.76 
 
 
280 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0602  degV family protein  30.8 
 
 
281 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129172  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  28.06 
 
 
293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  27.05 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  29.79 
 
 
281 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  27.4 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  27.4 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  27.4 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  27.4 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  27.4 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  27.4 
 
 
280 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  27.4 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  28.12 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  31.07 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  30.69 
 
 
285 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  27.56 
 
 
285 aa  128  8.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  28.01 
 
 
282 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  28.83 
 
 
291 aa  125  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3640  degV family protein  25.72 
 
 
284 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00084182  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  35.38 
 
 
283 aa  123  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  27.4 
 
 
282 aa  123  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  28.88 
 
 
279 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1018  hypothetical protein  27.08 
 
 
313 aa  123  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0136614  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  25.17 
 
 
285 aa  123  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  28.88 
 
 
279 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1346  degV family protein  27.54 
 
 
285 aa  122  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000423289  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  28.67 
 
 
284 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  26.32 
 
 
292 aa  122  9e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  27.76 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  28.67 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  27.96 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  31.37 
 
 
279 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  31.22 
 
 
279 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  29.54 
 
 
282 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  31.65 
 
 
288 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  30.34 
 
 
292 aa  119  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0773  degV family protein  31.65 
 
 
288 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  28.52 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  27.05 
 
 
286 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  29.14 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  27.05 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  30.99 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  27.05 
 
 
286 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  28.17 
 
 
283 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>