246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1076 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  100 
 
 
280 aa  569  1e-161  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  93.21 
 
 
280 aa  533  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  92.14 
 
 
281 aa  532  1e-150  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  53.07 
 
 
279 aa  314  8e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  52.71 
 
 
279 aa  312  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  51.99 
 
 
279 aa  309  4e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  50.91 
 
 
281 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  49.82 
 
 
281 aa  275  4e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  50 
 
 
276 aa  269  4e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  44.53 
 
 
279 aa  240  1e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  44 
 
 
279 aa  240  2e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  44.89 
 
 
279 aa  239  4e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  44.53 
 
 
279 aa  238  6.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  44.36 
 
 
279 aa  237  1e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  44 
 
 
279 aa  238  1e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  42.09 
 
 
282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  35.66 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  37.32 
 
 
311 aa  192  7e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  37.32 
 
 
311 aa  190  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  37.01 
 
 
279 aa  188  8e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  35.51 
 
 
310 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  38.21 
 
 
277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  36.36 
 
 
280 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  39.36 
 
 
282 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  31.27 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  33.81 
 
 
281 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  34.43 
 
 
280 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  31.41 
 
 
282 aa  159  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  33.33 
 
 
282 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  33.22 
 
 
283 aa  156  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  35.64 
 
 
279 aa  156  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  32.73 
 
 
280 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  31.34 
 
 
287 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  32.73 
 
 
280 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  32.73 
 
 
280 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  33.33 
 
 
287 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  32.73 
 
 
287 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  32.73 
 
 
287 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  32.97 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  32.99 
 
 
299 aa  152  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  32.61 
 
 
280 aa  152  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  32.25 
 
 
280 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  35.04 
 
 
279 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  30.71 
 
 
280 aa  150  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  30.99 
 
 
287 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  32.49 
 
 
282 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  32.49 
 
 
282 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  33.57 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  32.37 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  30.69 
 
 
290 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  32.36 
 
 
280 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  28.88 
 
 
283 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3640  degV family protein  28.36 
 
 
284 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00084182  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0602  degV family protein  32.01 
 
 
281 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129172  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  28.42 
 
 
281 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  31.88 
 
 
279 aa  142  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  30.22 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  32.5 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  32.42 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  32.86 
 
 
283 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  30.74 
 
 
280 aa  139  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  31.1 
 
 
280 aa  139  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  31.1 
 
 
280 aa  139  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  30.63 
 
 
291 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  32.01 
 
 
271 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  31.41 
 
 
285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  29.79 
 
 
303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  28.88 
 
 
281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  31.1 
 
 
280 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  31.1 
 
 
280 aa  136  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  31.1 
 
 
280 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  29.68 
 
 
280 aa  136  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  31.1 
 
 
280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  31.1 
 
 
280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  31.1 
 
 
280 aa  135  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  31.1 
 
 
280 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  30.96 
 
 
283 aa  135  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  30.6 
 
 
283 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  30.29 
 
 
282 aa  133  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  29.68 
 
 
286 aa  132  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  31.41 
 
 
282 aa  132  9e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1014  hypothetical protein  29.86 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  29.33 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  30.53 
 
 
286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1941  degV family protein  29.82 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.676322  normal  0.0830662 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  28.98 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  28.27 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0442  DegV family protein  30.25 
 
 
291 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.416835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  32.01 
 
 
284 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  28.98 
 
 
286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  28.98 
 
 
286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  28.98 
 
 
286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  30.07 
 
 
288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  28.98 
 
 
286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  26.16 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  28.83 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  30.77 
 
 
288 aa  129  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  29.33 
 
 
286 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  29.93 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  35.47 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>