237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1050 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  583  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  46.26 
 
 
285 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  40.57 
 
 
283 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  40.57 
 
 
283 aa  228  6e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  31.23 
 
 
279 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  33.45 
 
 
280 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  33.69 
 
 
284 aa  159  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  34.39 
 
 
281 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  34.77 
 
 
285 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16150  hypothetical protein  32.16 
 
 
299 aa  155  5.0000000000000005e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000239728 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  33.45 
 
 
282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1149  degV family protein  33.8 
 
 
300 aa  153  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.286505  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  36.27 
 
 
282 aa  152  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  30.04 
 
 
291 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  31.56 
 
 
303 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  34.74 
 
 
281 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09170  degV family protein  32.62 
 
 
301 aa  148  8e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.266589 
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  33.33 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  32.16 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  32.16 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  32.16 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  32.16 
 
 
287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  32.16 
 
 
287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  33.1 
 
 
280 aa  146  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  31.45 
 
 
287 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  34.29 
 
 
280 aa  145  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  33.92 
 
 
279 aa  145  5e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  31.1 
 
 
280 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  31.8 
 
 
280 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  31.93 
 
 
282 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  30.99 
 
 
280 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  31.93 
 
 
282 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  32.4 
 
 
282 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  34.88 
 
 
287 aa  142  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  28.62 
 
 
291 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  29.54 
 
 
285 aa  142  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  34.29 
 
 
277 aa  142  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  31.34 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  30.82 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  29.54 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  31.12 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  33.22 
 
 
279 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  30.93 
 
 
286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  28.77 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  30.96 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  30.96 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  32.86 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  31.12 
 
 
281 aa  139  6e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  30.53 
 
 
281 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  31.6 
 
 
280 aa  139  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  30.96 
 
 
280 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  32.86 
 
 
279 aa  137  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  31.1 
 
 
280 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  31.49 
 
 
286 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  30.96 
 
 
280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  30.96 
 
 
280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  30.96 
 
 
280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  30.88 
 
 
286 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  30.88 
 
 
286 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  30.88 
 
 
286 aa  136  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  30.88 
 
 
286 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  29.86 
 
 
292 aa  136  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  30.99 
 
 
287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  30.96 
 
 
280 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  32.27 
 
 
282 aa  135  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  30.88 
 
 
286 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  30.53 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  31.25 
 
 
287 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  30.8 
 
 
286 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  30.6 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  30.63 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  30.6 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  30.99 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  30.18 
 
 
286 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  30.99 
 
 
279 aa  132  6e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  30.45 
 
 
286 aa  132  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  31.94 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  31.94 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  31.18 
 
 
276 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  29.08 
 
 
281 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  31.54 
 
 
279 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  28.92 
 
 
286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  32.97 
 
 
279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1032  degV family protein  27.76 
 
 
284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.185654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  30.85 
 
 
290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  32.75 
 
 
279 aa  129  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  32.06 
 
 
280 aa  128  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  32.64 
 
 
326 aa  129  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  31.18 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  30.21 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  27.92 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  32.16 
 
 
279 aa  126  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  32.98 
 
 
296 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  33.69 
 
 
282 aa  125  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2246  degV family protein  34.25 
 
 
297 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  28.97 
 
 
283 aa  125  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  28.37 
 
 
282 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  30.04 
 
 
280 aa  124  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  27.96 
 
 
287 aa  123  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0521  hypothetical protein  30.47 
 
 
278 aa  122  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>