240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1901 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  576  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  43.01 
 
 
290 aa  232  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  45.55 
 
 
287 aa  227  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  45.55 
 
 
287 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  39.07 
 
 
280 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  40.21 
 
 
293 aa  203  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  39.65 
 
 
286 aa  192  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  39.3 
 
 
286 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  39.3 
 
 
286 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  38.95 
 
 
286 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  38.95 
 
 
286 aa  189  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  38.95 
 
 
286 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  38.95 
 
 
286 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  38.81 
 
 
286 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  38.25 
 
 
286 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  38.81 
 
 
286 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  38.6 
 
 
286 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  36.3 
 
 
280 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  35.36 
 
 
281 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  35.54 
 
 
291 aa  175  7e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  36.65 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  34.53 
 
 
281 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  35.89 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  34.51 
 
 
312 aa  161  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  36.3 
 
 
279 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  35 
 
 
287 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  36.75 
 
 
286 aa  153  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  33.21 
 
 
281 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  32.1 
 
 
281 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  28.47 
 
 
281 aa  146  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  33.57 
 
 
282 aa  146  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0442  DegV family protein  35.36 
 
 
291 aa  145  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.416835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  31.32 
 
 
282 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  28.88 
 
 
280 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  28.88 
 
 
280 aa  142  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  32.38 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  33.57 
 
 
292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  33.56 
 
 
291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  32.1 
 
 
280 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  30.34 
 
 
292 aa  139  7e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  32.03 
 
 
279 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  30.4 
 
 
282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  29.89 
 
 
283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  31.14 
 
 
282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  30.77 
 
 
280 aa  135  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  30.77 
 
 
280 aa  135  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  31.25 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  30.63 
 
 
280 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  30.63 
 
 
280 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  30.63 
 
 
280 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  30.63 
 
 
280 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  30.26 
 
 
280 aa  132  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  30.26 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  30.26 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0022  degV family protein  34.17 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.314645  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  32.03 
 
 
279 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  31.58 
 
 
283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  31.14 
 
 
293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  28.32 
 
 
299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  31.34 
 
 
285 aa  129  8.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  30.94 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  31.23 
 
 
286 aa  127  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  32.37 
 
 
296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  29.14 
 
 
281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  31.29 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  29.64 
 
 
279 aa  125  7e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  30.58 
 
 
288 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  30 
 
 
284 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  31.41 
 
 
281 aa  125  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  29.89 
 
 
280 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11340  DegV family protein  31.32 
 
 
279 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  33.33 
 
 
289 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  29.5 
 
 
279 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  30.22 
 
 
280 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  32.14 
 
 
279 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  30.58 
 
 
288 aa  123  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  30.69 
 
 
281 aa  123  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06330  degV family protein  32.87 
 
 
293 aa  122  5e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.139961 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  29.29 
 
 
279 aa  122  5e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  30.69 
 
 
279 aa  122  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  30 
 
 
280 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  31.27 
 
 
287 aa  122  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  31.5 
 
 
279 aa  122  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  29.03 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1056  degV family protein  32.99 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  30.85 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  28.93 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  31.21 
 
 
285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1121  degV family protein  32.5 
 
 
294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  30.94 
 
 
311 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  28.47 
 
 
287 aa  118  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  28.47 
 
 
287 aa  118  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  28.47 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  28.47 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  28.47 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  32.28 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  29.23 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  28.11 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0606  DegV family protein  31.21 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  28.42 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>