234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1609 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  100 
 
 		 296 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  55.28 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  57.91 
 
 		 284 aa  255  8e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3849  degV family protein  57.71 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  52.52 
 
 		 283 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  52.33 
 
 		 326 aa  236  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2272  hypothetical protein  53.9 
 
 		 282 aa  225  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3470  degV family protein  57.71 
 
 		 286 aa  223  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.748591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  48.24 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2246  degV family protein  45.45 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6798  degV family protein  49.81 
 
 		 283 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28270  degV family protein  44.68 
 
 		 279 aa  182  9.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3526  degV family protein  44.21 
 
 		 278 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3599  degV family protein  44.21 
 
 		 278 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3531  degV family protein  44.21 
 
 		 278 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.766898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3190  degV family protein  42.86 
 
 		 286 aa  178  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  33.21 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  35.38 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1983  degV family protein  45.83 
 
 		 331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179481 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  40.65 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  42.11 
 
 		 285 aa  172  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  32.16 
 
 		 280 aa  170  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17350  degV family protein  44.05 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173682  hitchhiker  0.00667437 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  36.5 
 
 		 282 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  32.37 
 
 		 282 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12445  hypothetical protein  44.6 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6052  degV family protein  47.14 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  36.23 
 
 		 279 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  35.13 
 
 		 280 aa  165  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  36.23 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  35.13 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  35.13 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  35.13 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  35.13 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  35.13 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  35.13 
 
 		 280 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  34.41 
 
 		 280 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  34.41 
 
 		 280 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  36.23 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  34.3 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  35.97 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  41.82 
 
 		 282 aa  159  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  34.3 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  36.4 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  33.94 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  40 
 
 		 286 aa  156  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  34.02 
 
 		 283 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  32.86 
 
 		 283 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  33.68 
 
 		 283 aa  155  7e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  31.18 
 
 		 290 aa  155  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  33.33 
 
 		 279 aa  155  8e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  34.89 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  31.47 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  35.13 
 
 		 279 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  33.69 
 
 		 279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  34.41 
 
 		 284 aa  152  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  36.33 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  32.27 
 
 		 285 aa  149  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  33.7 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3922  degV family protein  41.11 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  32.62 
 
 		 281 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  37.01 
 
 		 279 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  33.22 
 
 		 283 aa  145  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2804  degV family protein  37.94 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  27.02 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  29.5 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  31.9 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  32.03 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  36.13 
 
 		 277 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  30.74 
 
 		 287 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  30.66 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12470  degV family protein  43.26 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.403372  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2657  degV family protein  40.74 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.108706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  34.27 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  33.09 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  31.52 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  32.25 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  28.04 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  30.88 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  31.88 
 
 		 287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  31.88 
 
 		 287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  31.88 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  31.88 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  31.8 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  29.93 
 
 		 282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  31.52 
 
 		 280 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  30 
 
 		 280 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  31.52 
 
 		 280 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  36.79 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2216  degV family protein  50 
 
 		 282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202222  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  28.37 
 
 		 285 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  29.79 
 
 		 284 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  31.65 
 
 		 282 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  31.65 
 
 		 282 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  32.75 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  31.34 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  31.52 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  31.54 
 
 		 285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  32.4 
 
 		 286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  29.63 
 
 		 288 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>