236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10840 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  100 
 
 		 291 aa  600  1e-170  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  71.03 
 
 		 292 aa  447  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06330  degV family protein  57.68 
 
 		 293 aa  360  1e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.139961 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  45.55 
 
 		 287 aa  251  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  44.79 
 
 		 291 aa  245  6.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  45.14 
 
 		 291 aa  228  8e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  41.26 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  38.33 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  40.56 
 
 		 286 aa  205  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  40.21 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  39.86 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  40.21 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  39.86 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  39.86 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  39.86 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  40.21 
 
 		 286 aa  202  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  39.51 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1558  DegV family protein  36.84 
 
 		 295 aa  202  8e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  39.51 
 
 		 286 aa  200  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  39.16 
 
 		 287 aa  198  7e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  39.72 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  37.46 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  37.76 
 
 		 287 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0606  DegV family protein  34.59 
 
 		 295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  35.66 
 
 		 281 aa  182  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  38.19 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1056  degV family protein  35.4 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  35.31 
 
 		 286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1121  degV family protein  32.63 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  33.92 
 
 		 285 aa  166  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  32.52 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  32.18 
 
 		 279 aa  148  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  32.06 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09150  hypothetical protein  32.41 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000277277  normal  0.476622 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  31.01 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16140  hypothetical protein  31.21 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224707 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1061  degV family protein  29.47 
 
 		 294 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0946944  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  33.45 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  31.56 
 
 		 280 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  29.07 
 
 		 285 aa  132  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  29.96 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09160  degV family protein  34.39 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.356982  normal  0.378413 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  27.02 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  30.42 
 
 		 282 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  31.96 
 
 		 290 aa  125  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1150  degV family protein  31.49 
 
 		 309 aa  125  8.000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.444716  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1342  DegV family protein  32.17 
 
 		 282 aa  125  9e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  28.33 
 
 		 312 aa  125  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0982  degV family protein  29.55 
 
 		 342 aa  122  7e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  28.67 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  31.36 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  29.93 
 
 		 284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  33.68 
 
 		 288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  29.27 
 
 		 287 aa  118  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  29.76 
 
 		 637 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  32.99 
 
 		 288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  28.52 
 
 		 280 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  28.92 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  28.77 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  28.57 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  28.57 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  28.57 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  28.28 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  28.57 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  28.22 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  26.67 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  28.22 
 
 		 280 aa  112  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  30 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0442  DegV family protein  31.34 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.416835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  30.21 
 
 		 293 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  30.77 
 
 		 296 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  29.27 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1644  degV family protein  29.58 
 
 		 604 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.524877  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  26.92 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  29.23 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  30.22 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  28.32 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  29.23 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  32.28 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0773  degV family protein  28.32 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  30.18 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  28.87 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  29.79 
 
 		 277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  28.87 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  30.18 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  28.37 
 
 		 282 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  28.37 
 
 		 282 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0416  DegV family protein  27.6 
 
 		 288 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  30.8 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  28.52 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  31.49 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  28.87 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  28.87 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  28.87 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  28.87 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  28.87 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  28.11 
 
 		 282 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0150  degV family protein  27.62 
 
 		 833 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  29.62 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  28.28 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>