236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0442 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0442  DegV family protein  100 
 
 
291 aa  597  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.416835  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  36.79 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  34.91 
 
 
279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  35.71 
 
 
281 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  37.55 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1216  DegV family protein  31.56 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  36.84 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  35.87 
 
 
280 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  35.87 
 
 
280 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  35.87 
 
 
287 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  35.87 
 
 
287 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  35.13 
 
 
281 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  35.51 
 
 
280 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  35.38 
 
 
280 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  36.96 
 
 
287 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  36.59 
 
 
280 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  35.56 
 
 
286 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  35.79 
 
 
286 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  35.61 
 
 
282 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  36.49 
 
 
286 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  35.61 
 
 
282 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  35.79 
 
 
286 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  35.79 
 
 
286 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  35.79 
 
 
286 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  35.79 
 
 
286 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  35.56 
 
 
286 aa  156  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  35.94 
 
 
281 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  35.56 
 
 
287 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  35.79 
 
 
286 aa  155  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  34.89 
 
 
280 aa  155  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  34.74 
 
 
286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  33.33 
 
 
280 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11340  DegV family protein  32.73 
 
 
279 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  31.9 
 
 
280 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  31.9 
 
 
280 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  35.36 
 
 
281 aa  149  7e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  34.31 
 
 
282 aa  149  8e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  31.77 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  31.77 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  31.77 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  31.77 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  31.77 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  31.77 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  31.77 
 
 
280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  32.38 
 
 
285 aa  145  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  31.14 
 
 
282 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  35.78 
 
 
299 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  30.94 
 
 
279 aa  143  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  32.39 
 
 
287 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  30.25 
 
 
281 aa  142  9e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  30.25 
 
 
280 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  30.36 
 
 
279 aa  140  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  32.49 
 
 
280 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  30.94 
 
 
280 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  30.22 
 
 
279 aa  139  7e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  30.25 
 
 
280 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0416  DegV family protein  36.45 
 
 
288 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  31.43 
 
 
281 aa  136  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  29.71 
 
 
282 aa  135  8e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  32.26 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  32.14 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  29.64 
 
 
284 aa  132  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  30.43 
 
 
279 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  30.43 
 
 
279 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  30.48 
 
 
292 aa  130  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  30.71 
 
 
287 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  30.25 
 
 
283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  29.62 
 
 
312 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  29.18 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  33.49 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  29.82 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0773  degV family protein  33.49 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  31.34 
 
 
291 aa  126  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0521  hypothetical protein  31.93 
 
 
278 aa  127  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  30 
 
 
279 aa  125  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  28.72 
 
 
291 aa  125  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  37.09 
 
 
279 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  36.62 
 
 
279 aa  125  9e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  30.32 
 
 
282 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  30.04 
 
 
293 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0600  degV family protein  28.98 
 
 
683 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100467 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  25 
 
 
303 aa  123  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0772  degV family protein  31.25 
 
 
280 aa  123  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  28.42 
 
 
281 aa  122  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1644  degV family protein  29.97 
 
 
604 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.524877  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  33.64 
 
 
279 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  29.56 
 
 
281 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  29.56 
 
 
281 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  28.11 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0910  hypothetical protein  31.47 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104198 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  33.18 
 
 
279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0022  degV family protein  32.14 
 
 
288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.314645  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  30.39 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3344  DegV family protein  29.18 
 
 
277 aa  119  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000036416  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  27.8 
 
 
283 aa  119  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1014  hypothetical protein  29.79 
 
 
282 aa  119  7e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  30.04 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  29.07 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  30.07 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  29.27 
 
 
637 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>