232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3275 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  100 
 
 		 292 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  39.93 
 
 		 291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  39.72 
 
 		 287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  38.89 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  38.33 
 
 		 291 aa  206  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  39.93 
 
 		 291 aa  205  6e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1056  degV family protein  38.36 
 
 		 297 aa  199  7e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  36.11 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0606  DegV family protein  33.9 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  35.42 
 
 		 286 aa  176  5e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06330  degV family protein  33.45 
 
 		 293 aa  176  6e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.139961 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1558  DegV family protein  37.92 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  33.68 
 
 		 289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  35.69 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  34.28 
 
 		 286 aa  170  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  34.98 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  34.63 
 
 		 286 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  34.63 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  34.63 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  34.63 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  34.98 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  34.63 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  34.63 
 
 		 286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  32.86 
 
 		 281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  32.51 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  35.36 
 
 		 289 aa  166  5e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  34.63 
 
 		 286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1061  degV family protein  34.25 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0946944  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1121  degV family protein  31.88 
 
 		 294 aa  162  7e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  34.62 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  32.51 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  33.1 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  33.45 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  31.45 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  32.04 
 
 		 281 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16140  hypothetical protein  31.33 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224707 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09150  hypothetical protein  31.76 
 
 		 309 aa  145  6e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000277277  normal  0.476622 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  33.8 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1150  degV family protein  32.64 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.444716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  31.34 
 
 		 283 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  33.57 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  30.42 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  29.93 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  30.74 
 
 		 282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  32.06 
 
 		 281 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  31.94 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  31.01 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  30.63 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  30.07 
 
 		 312 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  31.23 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  30.88 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  31.36 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  33.64 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09160  degV family protein  32.08 
 
 		 311 aa  124  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.356982  normal  0.378413 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  27.62 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  30.77 
 
 		 285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  27.62 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  29.79 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  31.25 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  30.56 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  30.56 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  30.82 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0982  degV family protein  29.9 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  29.07 
 
 		 299 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  30.56 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  30.21 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  30.56 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  29.07 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  31.56 
 
 		 279 aa  115  6e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  30.21 
 
 		 280 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  30.21 
 
 		 280 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  30.21 
 
 		 280 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  30.04 
 
 		 279 aa  115  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  29.47 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  30.85 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  28.97 
 
 		 280 aa  113  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0600  degV family protein  27.97 
 
 		 683 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100467 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  28.03 
 
 		 287 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  31.45 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  25.96 
 
 		 303 aa  112  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  28.03 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  26.64 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  27.02 
 
 		 281 aa  112  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  26.86 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  28.62 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  28.62 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  28.62 
 
 		 287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  26.57 
 
 		 281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  28.62 
 
 		 287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  28.37 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  27.53 
 
 		 637 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1342  DegV family protein  29.27 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  28.57 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  28.07 
 
 		 280 aa  109  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  32.41 
 
 		 279 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11340  DegV family protein  29.08 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  28.42 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1644  degV family protein  31.12 
 
 		 604 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.524877  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  28.42 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  31.72 
 
 		 279 aa  106  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>